RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 OR10X1Q8NGY0 326 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 OR2T10Q8NGZ9 312 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 OR8U1Q8NH10 309 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 OR5AK2Q8NH90 309 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 PYDC1Q8WXC3 89 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 CYYR1Q96J86 154 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 Q96MT0 163 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 CIB1Q99828 191 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 PSG11Q9UQ72 335 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 ORC6Q9Y5N6 252 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 INS-IGF2F8WCM5 200 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 C3orf84H3BNL1 204 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 ORC5O43913 435 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 HSBP1O75506 76 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 HPRT1P00492 218 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 IGKV1D-33P01593 117 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 IGKV1-33P01594 117 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 CD2P06729 351 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 SRMP19623 302 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 RAB3AP20336 220 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 IL3RAP26951 378 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 BCAP31P51572 246 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 ERCC8Q13216 396 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 GPR176Q14439 515 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 RSU1Q15404 277 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC58Q4VC31 144 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 LINC00596Q86U02 117 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 PCP2Q8IVA1 136 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 LINC00311Q8N616 119 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 OR51A4Q8NGJ6 313 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 OR5D18Q8NGL1 313 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 PPP1R14BQ96C90 147 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 SPACA5Q96QH8 159 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 GPER1Q99527 375 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 S100A13Q99584 98 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 ABCG5Q9H222 651 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 PSG8Q9UQ74 426 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 U3KQK5 164 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 SIVA1O15304 175 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP10-5P60370 271 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 RPEL1Q2QD12 228 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 MPV17LQ2QL34 196 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 STX19Q8N4C7 294 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 ZFP41Q8N8Y5 198 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 OR10AC1Q8NH08 325 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 OR52N1Q8NH53 320 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 C4orf3Q8WVX3 66 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 ARL11Q969Q4 196 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 MRGPRFQ96AM1 343 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 C9orf16Q9BUW7 83 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 METTL9Q9H1A3 318 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 SPACA1Q9HBV2 294 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM138Q9NPI0 162 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 WSB1Q9Y6I7 421 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 TRAV6A0A075B6T7 132 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 MCRIP1C9JLW8 97 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 C15orf65H3BRN8 121 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 GABRPO00591 440 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 GABARAPO95166 117 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 IGHV3-7P01780 117 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 MT-ND4P03905 459 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 GLAP06280 429 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 GTF2F2P13984 249 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 PSMB8P28062 276 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 SSTR5P35346 364 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 GNG10P50151 68 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 CCR6P51684 374 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF137PP52743 207 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 RBM11P57052 281 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 RAB25P57735 213 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 PPP3R1P63098 170 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 RUNX1Q01196 453 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 LTC4SQ16873 150 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 LPCAT4Q643R3 524 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 CBR4Q8N4T8 237 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 Q8N6K4 173 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM104Q8NE00 496 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 OR51A2Q8NGJ7 313 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 LEAP2Q969E1 77 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 IFI27L2Q9H2X8 130 aa3.8□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 LINC00527Q9UJ94 153 aa3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms