RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 PTPRFP10586 1907 aa-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 ABCC11Q96J66 1382 aa-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 GOLGA8KD6RF30 607 aa-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 CCL16O15467 120 aa-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 SSNA1O43805 119 aa-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 CALUO43852 315 aaPredicted RBP-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 NUPR1O60356 82 aa-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 GRK1Q15835 563 aa-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 CLVS2Q5SYC1 327 aa-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 C10orf99Q6UWK7 81 aa-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 MIR17HGQ75NE6 70 aa-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 OR10J5Q8NHC4 309 aa-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 TEX47Q8TBZ9 253 aa-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 ORMDL1Q9P0S3 153 aa-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 HS3ST2Q9Y278 367 aa-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 JMJD1CQ15652 2540 aa-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 MYH7BA7E2Y1 1941 aa-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 MYO3BQ8WXR4 1341 aa-0.17□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 TRAV3A0A0B4J244 114 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 A0A1B0GV50 99 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 H3BRM9 83 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 GPR31O00270 319 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 PFDN6O15212 129 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 AHSA1O95433 338 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 HIST1H2BOP23527 126 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 HIST1H2BBP33778 126 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 HIST1H2BDP58876 126 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 NAA20P61599 178 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 HIST1H2BCP62807 126 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 HIST2H2BEQ16778 126 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 DEFB113Q30KQ7 82 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 SPATA45Q537H7 98 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 C2orf82Q6UX34 121 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 TEN1Q86WV5 123 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 HIST3H2BBQ8N257 126 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00301Q8NCQ3 95 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 OR13C4Q8NGS5 318 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM254Q8TBM7 123 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 HIST1H2BHQ93079 126 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 GPR146Q96CH1 333 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 HIST1H2BNQ99877 126 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 HIST1H2BMQ99879 126 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 PSTPIP2Q9H939 334 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM138Q9NPI0 162 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 SLC39A9Q9NUM3 307 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 TAS2R7Q9NYW3 318 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 C3orf18Q9UK00 162 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 EPDR1Q9UM22 224 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 U3KQA8 63 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 SIP14410 1827 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 SPAG17Q6Q759 2223 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa-0.18□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 PIK3R4Q99570 1358 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 SCN8AQ9UQD0 1980 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 ECM29Q5VYK3 1845 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 ERICH2A1L162 156 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF727A8MUV8 499 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 F8W1H4 67 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 CXCR6O00574 342 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 IFNA10P01566 189 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 CCL4P13236 92 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 UCHL3P15374 230 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 S100A4P26447 101 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 MAGEA2P43356 314 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 HBA1P69905 142 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 MED21Q13503 144 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 COQ5Q5HYK3 327 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 Q6ZS49 121 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 PRR15Q8IV56 129 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 OR2T35Q8NGX2 323 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 FAM213BQ8TBF2 198 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 KLK6Q92876 244 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 TP53RKQ96S44 253 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 GPER1Q99527 375 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 WFDC10AQ9H1F0 79 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 OR51V1Q9H2C8 321 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 C14orf132Q9NPU4 83 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 ERGIC3Q9Y282 383 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF292O60281 2723 aa-0.19□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.9 ms