RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552338.5

LIMA1-211, Transcript of LIM domain and actin binding 1, humanhuman

TSL 4

Gene LIMA1, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMA1-211ENST00000552338 SELENOTP62341 195 aa7.39□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 OPCMLQ14982 345 aa7.39□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 SLC51BQ86UW2 128 aa7.39□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 LILRB2Q8N423 598 aa7.39□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 GINS3Q9BRX5 216 aa7.39□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.39□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 TGOLN2O43493 480 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 GNG7O60262 68 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 SCGB2A1O75556 95 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 OR2C1O95371 312 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 TOMM40O96008 361 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 IFNA5P01569 189 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 CLEC3BP05452 202 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 SERF2P84101 59 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 PRR20EP86478 221 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 PRR20CP86479 221 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 PRR20DP86480 221 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 PRR20BP86481 221 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 PRR20AP86496 221 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 FHL3Q13643 280 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 ACSM6Q6P461 480 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 BTNL8Q6UX41 500 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 GPHB5Q86YW7 130 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 OR2G3Q8NGZ4 309 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 MGST2Q99735 147 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 ZNF747Q9BV97 191 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.38□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 AGPAT2O15120 278 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 GGCTO75223 188 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 SEC11BP0C7V7 166 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 LINC00869P0C866 280 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 SPP1P10451 314 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 CD28P10747 220 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 OR10J1P30954 320 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 RAB31Q13636 194 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 CLINT1Q14677 625 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 BAP18Q8IXM2 172 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 GNB4Q9HAV0 340 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 LGALS9O00182 355 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 BMPR1BO00238 502 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 NDUFA4O00483 81 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 FABP1P07148 127 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 TPT1P13693 172 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 ATP6V0CP27449 155 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 RIPPLY3P57055 190 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 AKR1C1Q04828 323 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 ACY3Q96HD9 319 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 CHRDL1Q9BU40 450 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.35□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 OR2T8A6NH00 312 aa7.35□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 ZFP92A6NM28 416 aa7.35□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 K7EMT4 169 aa7.35□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 TRBV12-3P01733 135 aa7.35□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 IGHV3-48P01763 117 aa7.35□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 PSG1P11464 419 aa7.35□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 ZP3P21754 424 aa7.35□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 FGF7P21781 194 aa7.35□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 GPR183P32249 361 aa7.35□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 ARL3P36405 182 aa7.35□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 CAMLGP49069 296 aa7.35□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 DEFA5Q01523 94 aa7.35□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 Q56UQ5 140 aa7.35□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 REC114Q7Z4M0 266 aa7.35□□□□□ -1.23
LIMA1-211ENST00000552338 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.35□□□□□ -1.23
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