RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 Q96MF0 132 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 VAX2Q9UIW0 290 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 G3V318 75 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 IFNA1P01562 189 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 CTRB1P17538 263 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 AWAT1Q58HT5 328 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 MORN5Q5VZ52 161 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 Q8N6K4 173 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 SUN5Q8TC36 379 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 H3BUX3 64 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 COX7A2P2O60397 106 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 OR2J3O76001 311 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 ATP5G3P48201 142 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 CD81P60033 236 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 C11orf94C9JXX5 98 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 FNDC10F2Z333 226 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 H3BQ15 152 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 ATP6V0E1O15342 81 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 EBI3Q14213 229 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 LEMD1Q68G75 181 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 MS4A10Q96PG2 267 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.65□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 CORTO00230 105 aa6.65□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 STAG3L2P0CL84 134 aa6.65□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 STAG3L3P0CL85 134 aa6.65□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 ISOC2Q96AB3 205 aa6.65□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.65□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.65□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.65□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 I3L2K1 104 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 CXorf1O96002 111 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 LYZP61626 148 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 ZNF114Q8NC26 417 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 FUT9Q9Y231 359 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 ZNF727A8MUV8 499 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 K7EIM0 57 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 GCHFRP30047 84 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 TIGITQ495A1 244 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 PIFOQ8TCI5 191 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 A0A096LNT2 108 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 H3BTX0 84 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 GNG7O60262 68 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 CRYGCP07315 174 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 PYYP10082 97 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 PSG1P11464 419 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 Q56UQ5 140 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 PATE2Q6UY27 113 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 NANPQ8TBE9 248 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 DERL1Q9BUN8 251 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 NDUFB4O95168 129 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 HLA-DRB1P01911 266 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 PAX1P15863 534 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 BLCAPP62952 87 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 MANBALQ9NQG1 85 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 OR2T8A6NH00 312 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 NDUFB8O95169 186 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 IGLC1P0CG04 106 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 RD3LP0DJH9 198 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 SELENOTP62341 195 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.63□□□□□ -1.35
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