RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 C11orf53Q8IXP5 236 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 MUC15Q8N387 334 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 HINT2Q9BX68 163 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 TMEM140Q9NV12 185 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 C2orf70A6NJV1 201 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 H0YJW9 148 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 M0R2Z0 102 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 CORTO00230 105 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 PPBPP02775 128 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 ZNF134P52741 427 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 SELENOVP59797 346 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 SLC24A4Q8NFF2 622 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 VWC2LB2RUY7 222 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 TAX1BP3O14907 124 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 OR7C2O60412 319 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 HSBP1O75506 76 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 HLA-DQA1P01909 254 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 GPR12P47775 334 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 KLRB1Q12918 225 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 TEPPQ6URK8 271 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 OSTCQ9NRP0 149 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 TNCP24821 2201 aa7.43□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 C15orf65H3BRN8 121 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 THBDP07204 575 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 AREGP15514 252 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 MFAP2P55001 183 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 PRR20EP86478 221 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 PRR20CP86479 221 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 PRR20DP86480 221 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 PRR20BP86481 221 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 PRR20AP86496 221 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 TIGITQ495A1 244 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 OR8B3Q8NGG8 313 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 RND1Q92730 232 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 SGK494Q96LW2 274 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 OR8B2Q96RD0 313 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 TNFRSF19Q9NS68 423 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 CAMPP49913 170 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 UBE2G1P62253 170 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 Q8IYB0 196 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 NABP2Q9BQ15 211 aa7.42□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa7.41□□□□□ -1.22
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THBS3-211ENST00000541990 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 GNLYP22749 145 aa7.41□□□□□ -1.22
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THBS3-211ENST00000541990 UCNP55089 124 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 BSPH1Q075Z2 132 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 MUC21Q5SSG8 566 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 PRR27Q6MZM9 219 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 DEFB108BQ8NET1 73 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 VPS25Q9BRG1 176 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 CST9LQ9H4G1 147 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 PRORYQ9H606 182 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 IL19Q9UHD0 177 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 ISLRO14498 428 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 LY6HO94772 140 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 REG1AP05451 166 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
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THBS3-211ENST00000541990 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 GNG12Q9UBI6 72 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 C16orf97H3BN30 126 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 NUDT3O95989 172 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 CCL8P80075 99 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 ADORA2A-AS1P86434 159 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 CD177Q8N6Q3 437 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 NUP35Q8NFH5 326 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.4□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.4□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 PPOXP50336 477 aa7.4□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.4□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.4□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 OR9G1Q8NH87 305 aa7.4□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 ZNF835Q9Y2P0 537 aa7.4□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa7.4□□□□□ -1.23
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