RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 TNFSF8P32971 234 aa8.59□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 P2RY1P47900 373 aa8.59□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 TMBIM6P55061 237 aa8.59□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.59□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.59□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.59□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 RAB2BQ8WUD1 216 aa8.59□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 GLMPQ8WWB7 406 aa8.59□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.59□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 METTL26Q96S19 204 aa8.59□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 ENY2Q9NPA8 101 aa8.59□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 DEFB4AO15263 64 aa8.58□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.58□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 RND2P52198 227 aa8.58□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 IL18Q14116 193 aa8.58□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.58□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 Q8NAQ8 132 aa8.58□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.58□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 OR1S2Q8NGQ3 325 aa8.58□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 IL22RA2Q969J5 263 aa8.58□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 PRRT1Q99946 306 aa8.58□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 BCL7BQ9BQE9 202 aa8.58□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.58□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 RABL2BQ9UNT1 228 aa8.58□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 KNCNA6PVL3 124 aa8.57□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 H3BMQ9 156 aa8.57□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC25A4P12235 298 aa8.57□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 C4BPBP20851 252 aa8.57□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 OR10J1P30954 320 aa8.57□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 STXBP6Q8NFX7 210 aa8.57□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.57□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 Q8WTZ3 238 aa8.57□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 NPIPB3Q92617 1050 aa8.57□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 HSPB7Q9UBY9 170 aa8.57□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 RABAC1Q9UI14 185 aa8.57□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 X6R8D5 127 aa8.57□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 DNAH2Q9P225 4427 aa8.56□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.56□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A0B4J2A0 478 aa8.56□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa8.56□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 CEBPZOSA8MTT3 80 aa8.56□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 BUB3O43684 328 aa8.56□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 PITX3O75364 302 aa8.56□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF688P0C7X2 276 aa8.56□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 SULT1A3P0DMM9 295 aa8.56□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 SULT1A4P0DMN0 295 aa8.56□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.56□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 RAB40CQ96S21 281 aa8.56□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 SHPKQ9UHJ6 478 aa8.56□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa8.56□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 FABP12A6NFH5 140 aa8.55□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 DEDDO75618 318 aa8.55□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 TOMM40O96008 361 aa8.55□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 PSG1P11464 419 aa8.55□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 NPY1RP25929 384 aa8.55□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 CCR6P51684 374 aa8.55□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 PRR20EP86478 221 aa8.55□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 PRR20CP86479 221 aa8.55□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 PRR20DP86480 221 aa8.55□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 PRR20BP86481 221 aa8.55□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 PRR20AP86496 221 aa8.55□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 STHQ8IWL8 128 aa8.55□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 TRIM63Q969Q1 353 aa8.55□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 RBKSQ9H477 322 aa8.55□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa8.55□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 U3KQ87 197 aa8.55□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.54□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.54□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 IL4P05112 153 aa8.54□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 RD3LP0DJH9 198 aa8.54□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 AKR1C4P17516 323 aa8.54□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 DHRS2Q13268 280 aa8.54□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 GAMTQ14353 236 aa8.54□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 SMCO1Q147U7 214 aa8.54□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.54□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.54□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 ACY3Q96HD9 319 aa8.54□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 MFFQ9GZY8 342 aa8.54□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 HRH4Q9H3N8 390 aa8.54□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
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