RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 TRGV9Q99603 122 aa9.29□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.29□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.29□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa9.28□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 OR2T8A6NH00 312 aa9.28□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 AGPAT2O15120 278 aa9.28□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 IGHV3-11P01762 117 aa9.28□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 IGLC1P0CG04 106 aa9.28□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 GPR183P32249 361 aa9.28□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 CAMLGP49069 296 aa9.28□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 SELENOTP62341 195 aa9.28□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 CLEC19AQ6UXS0 136 aa9.28□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 PRIMA1Q86XR5 153 aa9.28□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 BAP18Q8IXM2 172 aa9.28□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.28□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 GINS3Q9BRX5 216 aa9.28□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 ARV1Q9H2C2 271 aa9.28□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.28□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 F8W735 103 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 TGOLN2O43493 480 aa9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 CLEC3BP05452 202 aa9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 ATP6V0CP27449 155 aa9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 ARL3P36405 182 aa9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 RELQ04864 619 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 AWAT1Q58HT5 328 aa9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 ST8SIA2Q92186 375 aa9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 MGST2Q99735 147 aa9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 GGTLC1Q9BX51 225 aa9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 GNB4Q9HAV0 340 aa9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 NUDT19A8MXV4 375 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 CFDP00746 253 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 IGKV1-17P01599 117 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 CD28P10747 220 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 RPL29P47914 159 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 RUNX1Q01196 453 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 ZNF616Q08AN1 781 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 TIGITQ495A1 244 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 BPIFCQ8NFQ6 507 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 OR5B12Q96R08 314 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 RSG1Q9BU20 258 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 SLC45A2Q9UMX9 530 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 ANKRD34BA5PLL1 514 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 GGCTO75223 188 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 TOMM40O96008 361 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 CTSGP08311 255 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 SEC11BP0C7V7 166 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 RD3LP0DJH9 198 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 SPP1P10451 314 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 B2MP61769 119 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 SERF2P84101 59 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 ZNF600Q6ZNG1 722 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 STPG3Q8N7X2 389 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 Q8WTZ3 238 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 TMEM158Q8WZ71 300 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 CHRDL1Q9BU40 450 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 C19orf24Q9BVV8 132 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 SLC25A32Q9H2D1 315 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 PXMP4Q9Y6I8 212 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 PPP5D1E7EU14 171 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 I3L521 148 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 TSPAN15O95858 294 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 MBP02144 154 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 ADMP35318 185 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 PRR20EP86478 221 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 PRR20CP86479 221 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 PRR20DP86480 221 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 PRR20BP86481 221 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 PRR20AP86496 221 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 ZNF90Q03938 601 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 MIC13Q5XKP0 118 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 Q6ZRG5 221 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 C11orf44Q8N8P7 122 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 OR51G1Q8NGK1 321 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 SH3BGRL3Q9H299 93 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 UMAD1C9J7I0 102 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.9 ms