RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527136.1

SIGIRR-208, Transcript of single Ig and TIR domain containing, humanhuman

TSL 4

Gene SIGIRR, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGIRR-208ENST00000527136 NHLH2Q02577 135 aa8.4□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.4□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.4□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 OR10P1Q8NGE3 313 aa8.4□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 ZNF502Q8TBZ5 544 aa8.4□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.4□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 NPIPB3Q92617 1050 aa8.4□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 SLC35E1Q96K37 410 aa8.4□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 CXorf58Q96LI9 332 aa8.4□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.4□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 CITED1Q99966 193 aa8.4□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 A0A087WW49 117 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 G3V3Q6 166 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 GNG7O60262 68 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 BRI3O95415 125 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 GYPEP15421 78 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 ARL3P36405 182 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 AKR1C1Q04828 323 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 SLC38A11Q08AI6 406 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 CLINT1Q14677 625 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 ZNF343Q6P1L6 599 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 ZNF546Q86UE3 836 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 STX12Q86Y82 276 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 OR11H1Q8NG94 326 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 ASB13Q8WXK3 278 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 DPF1Q92782 380 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 SLC25A31Q9H0C2 315 aa8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.38□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 I3L521 148 aa8.38□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 ARPC5O15511 151 aa8.38□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 OR2C1O95371 312 aa8.38□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 SULT1A1P50225 295 aa8.38□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 SLURP1P55000 103 aa8.38□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 GAMTQ14353 236 aa8.38□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 TIGITQ495A1 244 aa8.38□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.38□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.37□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 PRSS46E5RG02 174 aa8.37□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 LINC01619G3V211 115 aa8.37□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 CCL24O00175 119 aa8.37□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 TGOLN2O43493 480 aa8.37□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 TSPAN15O95858 294 aa8.37□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 SLC25A4P12235 298 aa8.37□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 LYL1P12980 280 aa8.37□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 NPBWR1P48145 328 aa8.37□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 KLK9Q2XQG4 91 aa8.37□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.37□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 OR1S2Q8NGQ3 325 aa8.37□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.37□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.37□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.37□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.37□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 HSPB11Q9Y547 144 aa8.37□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 ZNF320A2RRD8 509 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 ZFP92A6NM28 416 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 BMPR1BO00238 502 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 PFDN1O60925 122 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 CLN5O75503 358 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 YIF1AO95070 293 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 MED14OSP0DP75 135 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 MALP21145 153 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 OR10J1P30954 320 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 S100A11P31949 105 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 HBG1P69891 147 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 HBG2P69892 147 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 DLK1P80370 383 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 ZNF616Q08AN1 781 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 OR2F1Q13607 317 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 RPEL1Q2QD12 228 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 OR4X1Q8NH49 305 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 NEURL2Q9BR09 285 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 MFFQ9GZY8 342 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.36□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 GGCTO75223 188 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 CTSGP08311 255 aa8.35□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 SYNJ2BPP57105 145 aa8.35□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 ZNF90Q03938 601 aa8.35□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 BAXQ07812 192 aa8.35□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.35□□□□□ -1.07
SIGIRR-208ENST00000527136 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms