RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM61Q8N0U2 210 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 C8orf31Q8N9H6 132 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 NPBQ8NG41 125 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 OR52I1Q8NGK6 324 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 OR1L6Q8NGR2 347 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 OR2G2Q8NGZ5 317 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 OR11H2Q8NH07 326 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 OR52N1Q8NH53 320 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 OR4A5Q8NH83 315 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 MITD1Q8WV92 249 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 C10orf35Q96D05 121 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 CMTM5Q96DZ9 223 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 NRBF2Q96F24 287 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 PELI1Q96FA3 418 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 ABHD14BQ96IU4 210 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 LINC00574Q9H8X3 128 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 TAF9BQ9HBM6 251 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 CLN6Q9NWW5 311 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 WASHC3Q9Y3C0 194 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 PEX16Q9Y5Y5 336 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 S4R3C0 116 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 KMT2AQ03164 3969 aa2.22□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 TRAV10A0A0B4J240 114 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 DAPL1A0PJW8 107 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 HSBP1L1C9JCN9 74 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 H3BUA1 57 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 SULT1B1O43704 296 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 GGCTO75223 188 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 OR2J3O76001 311 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 IFNA21P01568 189 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 IFNA17P01571 189 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 APOA2P02652 100 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 RPSAP08865 295 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 HSMCR30P0CW71 290 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 CT45A6P0DMU7 189 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 CT45A5P0DMU8 189 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 CT45A7P0DMV0 189 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 RAB3AP20336 220 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 CBLN1P23435 193 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 HLA-DMBP28068 263 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 TFPI2P48307 235 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 MNAT1P51948 309 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF137PP52743 207 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 RBM11P57052 281 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 TCTAP57738 103 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP10-10P60014 251 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 MED21Q13503 144 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 TNXAQ16473 311 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 Q3ZCU0 254 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 ELP2Q6IA86 826 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 DHFR2Q86XF0 187 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 APRG1Q8IVJ8 170 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 GID4Q8IVV7 300 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 DEFB107AQ8IZN7 70 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 PXT1Q8NFP0 134 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 OR51A4Q8NGJ6 313 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 OR5D14Q8NGL3 314 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 CD300LFQ8TDQ1 290 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 ACOT12Q8WYK0 555 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 GHSRQ92847 366 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 GALNT14Q96FL9 552 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 USMG5Q96IX5 58 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 THTPAQ9BU02 230 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 PRRG3Q9BZD7 231 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 BANF2Q9H503 90 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 RHOFQ9HBH0 211 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 TAS2R4Q9NYW5 299 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 ABRACLQ9P1F3 81 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 JPT1Q9UK76 154 aa2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 FAT2Q9NYQ8 4349 aa2.2□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa2.2□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.2□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 OR5H14A6NHG9 310 aa2.2□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 C11orf94C9JXX5 98 aa2.2□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 H0YJW9 148 aa2.2□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 M0R1X1 148 aa2.2□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 RAB29O14966 203 aa2.2□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 YPEL1O60688 119 aa2.2□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 RBBP9O75884 186 aa2.2□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 SULT1C4O75897 302 aa2.2□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 S1PR2O95136 353 aa2.2□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 SCTP09683 121 aa2.2□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 P0DMU3 169 aa2.2□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 FAM231AP0DMU4 169 aa2.2□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 FAM231CP0DMU5 169 aa2.2□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
CLVS1-209ENST00000522928 CEACAM6P40199 344 aa2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms