RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	NUDT3	O95989	172 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	PAX9	P55771	341 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	LY6E	Q16553	131 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193		U3KQA8	63 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	MLANA	Q16655	118 aa		6.65	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		6.65	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	ERAS	Q7Z444	233 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	EPDR1	Q9UM22	224 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	GFRA3	O60609	400 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	PSMB2	P49721	201 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	UCN	P55089	124 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	TM4SF20	Q53R12	229 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	C7orf71	A4D174	169 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	HERVK_113	P61574	105 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	NPPC	P23582	126 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	GPR183	P32249	361 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	PSG9	Q00887	426 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	IL15RA	Q13261	267 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	PRELID3A	Q96N28	172 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	DLX1	P56177	255 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV1-39	P01597	117 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV1D-39	P04432	117 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	FOXL1	Q12952	345 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV3-15	P01624	115 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	CIDEA	O60543	219 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	TMPRSS3	P57727	454 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193		M0R3E3	92 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV3-20	P01619	116 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV1-16	P04430	117 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GUS0	222 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	GPX1	P07203	203 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	GZMB	P10144	247 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	FABP2	P12104	132 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	NUDT11	Q96G61	164 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	FMC1	Q96HJ9	113 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	TIMM23	O14925	209 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV3-1	P01715	115 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	ID1	P41134	155 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	WDR86	Q86TI4	376 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PS18	150 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193		M0R381	172 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	ATP5G2	Q06055	141 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	LCN12	Q6JVE5	192 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	ARPC1A	Q92747	370 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	RNF125	Q96EQ8	232 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00479	Q96M42	142 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM160	Q9NX00	188 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193		H3BVH4	76 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	DLX6	P56179	175 aa		6.61	□□□□□ -1.35

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