RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507771.5

ITGA3-210, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 399 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-210ENST00000507771 ATP6V1FQ16864 119 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF600Q6ZNG1 722 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 Q8WTZ3 238 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 NPVFQ9HCQ7 196 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 MBD2Q9UBB5 411 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 PRSS46E5RG02 174 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 F8W735 103 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 H0YIZ8 118 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 LGALS9O00182 355 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 RAB31Q13636 194 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 REC114Q7Z4M0 266 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 GINS3Q9BRX5 216 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 UQCC1Q9NVA1 299 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 DNHD1Q96M86 4753 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 IGSF23A1L1A6 192 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 CCNKO75909 580 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 CFDP00746 253 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 IGLC1P0CG04 106 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 RD3LP0DJH9 198 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 LYL1P12980 280 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 BMI1P35226 326 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 ADMP35318 185 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 TIGITQ495A1 244 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 TEPPQ6URK8 271 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 TRGV9Q99603 122 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 RNF126Q9BV68 326 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 TMEM147Q9BVK8 224 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-210ENST00000507771 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 SEC14L6B5MCN3 397 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 SAP30O75446 220 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 DFFBO76075 338 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 TOMM40O96008 361 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 S100A7P31151 101 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 INSL3P51460 131 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 NHLH2Q02577 135 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF546Q86UE3 836 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 AKAP14Q86UN6 197 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 THAP8Q8NA92 274 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 MARC2Q969Z3 335 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 A8MWP6 167 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 K7EMT4 169 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 IGKV1-17P01599 117 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 SELENOTP62341 195 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 ARL16Q0P5N6 197 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 S100A7AQ86SG5 101 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 OR51G1Q8NGK1 321 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 METTL26Q96S19 204 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 HSPB11Q9Y547 144 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 MPDU1O75352 247 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 IFNA5P01569 189 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 IL4P05112 153 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 IGLL1P15814 213 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 CLINT1Q14677 625 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 AQP10Q96PS8 301 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 ATP5SQ99766 215 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 A0A1W2PS18 150 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGA3-210ENST00000507771 C2orf70A6NJV1 201 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.8 ms