RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 RNF151Q2KHN1 245 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 C17orf58Q2M2W7 97 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF600Q6ZNG1 722 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 DKK4Q9UBT3 224 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 DYSFO75923 2080 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 HIGD1CA8MV81 97 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 A8MWL6 223 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 TM4SF5O14894 197 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 MAS1LP35410 378 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 PPOXP50336 477 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 STXBP6Q8NFX7 210 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 OR52E5Q8NH55 327 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM215AQ9Y5M1 114 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 ADIPOQQ15848 244 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 DIRC2Q96SL1 478 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 NOTCH2Q04721 2471 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 PROP1O75360 226 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 MT-ND6P03923 174 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 IL4P05112 153 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF788Q6ZQV5 615 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 IGFBPL1Q8WX77 278 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 NBEAQ8NFP9 2946 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 GGCTO75223 188 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 AMY1AP04745 511 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 LOXL3P58215 753 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 BRWD1-AS2P59051 145 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 PIP4P1Q86T03 277 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 SPACA3Q8IXA5 215 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 GBGT1Q8N5D6 347 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 F2RL2O00254 374 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 ISLRO14498 428 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 ORM1P02763 201 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 WNT2P09544 360 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 OR5R1Q8NH85 324 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 PMCHL2Q9BQD1 86 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 CLEC7AQ9BXN2 247 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF596Q8TC21 504 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 UBTD1Q9HAC8 227 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 IFITM10A6NMD0 228 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 OR5AL1P0C617 328 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 AREGP15514 252 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 CEACAM3P40198 252 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 PMCHL1Q16048 86 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 NRN1Q9NPD7 142 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 RAXQ9Y2V3 346 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 HCFC1P51610 2035 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 NCKAP5O14513 1909 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 LGALS7P47929 136 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 TFPI2P48307 235 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 TBR1Q16650 682 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 ACTL10Q5JWF8 245 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 ERASQ7Z444 233 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 C5orf17Q8NAS9 161 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 PRSS33Q8NF86 280 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 OR8A1Q8NGG7 326 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 NDUFAF3Q9BU61 184 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 TCF15Q12870 199 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 C11orf42Q8N5U0 333 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 Q8TCH9 128 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 IGLV1-44P01699 117 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 NHLH1Q02575 133 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 AARDQ4LEZ3 155 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 LCN12Q6JVE5 192 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 Q6ZS92 163 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 TPSG1Q9NRR2 321 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 FOXL1Q12952 345 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 CACNG8Q8WXS5 425 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 DSPP15924 2871 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 CNTFRP26992 372 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 H0YJW9 148 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 SNAI2O43623 268 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 COX19Q49B96 90 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 A6NNC1 897 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM178BH3BS89 294 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 M0QZ24 198 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 COL4A2P08572 1712 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM14BQ9NUH8 114 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms