RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 FAM229AH3BQW9 127 aa8.71□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 TNFAIP8O95379 198 aa8.71□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 IGKV1-17P01599 117 aa8.71□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 UCP1P25874 307 aa8.71□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 NPY1RP25929 384 aa8.71□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa8.71□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 PSMG4Q5JS54 123 aa8.71□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 Q6ZTC4 211 aa8.71□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 FAM219AQ8IW50 185 aa8.71□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 OR1S2Q8NGQ3 325 aa8.71□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 OR52E5Q8NH55 327 aa8.71□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 OR52I2Q8NH67 350 aa8.71□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 AP3S1Q92572 193 aa8.71□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 RNF126Q9BV68 326 aa8.71□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 FUNDC2Q9BWH2 189 aa8.71□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.71□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.71□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 MTFP1Q9UDX5 166 aa8.71□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.71□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 SLC25A4P12235 298 aa8.7□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 C4BPBP20851 252 aa8.7□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 DHODHQ02127 395 aa8.7□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 BSXQ3C1V8 233 aa8.7□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.7□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.7□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.7□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 NOXA1Q86UR1 476 aa8.7□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.7□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.7□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.7□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 U3KQE9 123 aa8.7□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 X6R8D5 127 aa8.7□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.69□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.69□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 CDS2O95674 445 aa8.69□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 RAB3DO95716 219 aa8.69□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 OR10J1P30954 320 aa8.69□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 RND2P52198 227 aa8.69□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 TAS2R19P59542 299 aa8.69□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 C2orf83Q53S99 150 aa8.69□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 PRSS54Q6PEW0 395 aa8.69□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 Q6ZRM9 215 aa8.69□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM229BQ8NBD8 167 aa8.69□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 MARCH1Q8TCQ1 289 aa8.69□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 ABHD1Q96SE0 405 aa8.69□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.69□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 EXTL2Q9UBQ6 330 aa8.69□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 A0A0G2JRQ6 117 aa8.68□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 CEBPZOSA8MTT3 80 aa8.68□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 IGLC1P0CG04 106 aa8.68□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 RD3LP0DJH9 198 aa8.68□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 P0DMU3 169 aa8.68□□□□□ -1.02
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CNOT4-211ENST00000498534 FAM231CP0DMU5 169 aa8.68□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 AARDQ4LEZ3 155 aa8.68□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 STEAP1BQ6NZ63 245 aa8.68□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 GLMPQ8WWB7 406 aa8.68□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 NDUFAF3Q9BU61 184 aa8.68□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 XCL2Q9UBD3 114 aa8.68□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.68□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 FAM90A26D6RGX4 464 aa8.67□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 CD74P04233 296 aa8.67□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 IL4P05112 153 aa8.67□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 OR5AC1P0C628 307 aa8.67□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 MEF2DQ14814 521 aa8.67□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 C12orf74Q32Q52 190 aa8.67□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.67□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.67□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.67□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 OR4D10Q8NGI6 311 aa8.67□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 GLYATL2Q8WU03 294 aa8.67□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 NPIPB3Q92617 1050 aa8.67□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 ACY3Q96HD9 319 aa8.67□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 NRN1Q9NPD7 142 aa8.67□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 CACNG5Q9UF02 275 aa8.67□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 HERC2O95714 4834 aa8.66□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 DISC1C4P0D8 188 aa8.66□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 H3BMM0 161 aa8.66□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 GABARAPH6UMI1 98 aa8.66□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 BUB3O43684 328 aa8.66□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 GABARAPO95166 117 aa8.66□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 AMBPP02760 352 aa8.66□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.66□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM268Q5VZI3 342 aa8.66□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF767PQ75MW2 155 aa8.66□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 GPR146Q96CH1 333 aa8.66□□□□□ -1.02
CNOT4-211ENST00000498534 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
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