RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-240ENST00000495293 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 SSSCA1O60232 199 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 PITX3O75364 302 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 MMP23AO75900 390 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 NDUFA7O95182 113 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 PPYP01298 95 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 SSTR5P35346 364 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 SNCAP37840 140 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 LPAR6P43657 344 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 GNG10P50151 68 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 RAB7AP51149 207 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 CEBPGP53567 150 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 HBG1P69891 147 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 HBG2P69892 147 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 HES1Q14469 280 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 CLINT1Q14677 625 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 GUCA2BQ16661 112 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 HLA-DRB5Q30154 266 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 Q3ZCU0 254 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 RNF212Q495C1 297 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 HCP5Q6MZN7 132 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 MOB1BQ7L9L4 216 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 TCF23Q7RTU1 214 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 LYZL2Q7Z4W2 148 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 OR4C13Q8NGP0 309 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 OR2T6Q8NHC8 308 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 GLYATL2Q8WU03 294 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 IL22RA2Q969J5 263 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 MRGPRFQ96AM1 343 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 CLCC1Q96S66 551 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 C12orf57Q99622 126 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 GINS3Q9BRX5 216 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 MXRA5Q9NR99 2828 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 CUBNO60494 3623 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 RBFOX3A6NFN3 312 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 C12orf77C9JDV5 145 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 M0QZK8 103 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 HSD17B6O14756 317 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 TGOLN2O43493 480 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 IGLV1-47P01700 117 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 IGHV3-7P01780 117 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 HBZP02008 142 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 CD5P06127 495 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 OR13C7P0DN81 318 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 CGB3P0DN86 165 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 CGB7P0DN87 165 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 IGHV3-43DP0DP04 118 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 FOLR2P14207 255 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 MDKP21741 143 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 VDAC1P21796 283 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 PAX6P26367 422 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 S100A2P29034 98 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 MEOX2P50222 304 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 DYNLT3P51808 116 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 UBE2KP61086 200 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 RND3P61587 244 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 MSMO1Q15800 293 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 MOB3BQ86TA1 216 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 ZFP82Q8N141 532 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 LYG1Q8N1E2 194 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 C8orf31Q8N9H6 132 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 OR4P4Q8NGL7 312 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 OR4A4PQ8NGN8 299 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 OR8U1Q8NH10 309 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 SGMS2Q8NHU3 365 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 RXFP4Q8TDU9 374 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 IL1F10Q8WWZ1 152 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 LEAP2Q969E1 77 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 RAB40CQ96S21 281 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 TMEM222Q9H0R3 208 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 TUBA4BQ9H853 241 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 LINC00574Q9H8X3 128 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 C1RLQ9NZP8 487 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 CACFD1Q9UGQ2 172 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 JPT1Q9UK76 154 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 PSG11Q9UQ72 335 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 TCF19Q9Y242 345 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 FBXO7Q9Y3I1 522 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 MMP24Q9Y5R2 645 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 DSCAML1Q8TD84 2053 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.2 ms