RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRSS54Q6PEW0 395 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMED4Q7Z7H5 227 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RNF183Q96D59 192 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RABAC1Q9UI14 185 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A0A0J9YWU9 116 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IFNA10P01566 189 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NPY1RP25929 384 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SRPXP78539 464 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SMCO1Q147U7 214 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LYG2Q86SG7 212 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR1S2Q8NGQ3 325 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 Q8WTZ3 238 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CSTL1Q9H114 145 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CRYBB3P26998 211 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR10J1P30954 320 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TNFRSF9Q07011 255 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM170AQ8WVE7 144 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRIM63Q969Q1 353 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RBKSQ9H477 322 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 U3KQ87 197 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 V9GYH0 126 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRAV2A0A0B4J234 112 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MPTX1A8MV57 137 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 JTBO76095 146 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGLC1P0CG04 106 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 P2RY1P47900 373 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DEFB131AP59861 70 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 STXBP6Q8NFX7 210 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR1S1Q8NH92 325 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DTD1Q8TEA8 209 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NPIPB3Q92617 1050 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ACY3Q96HD9 319 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GRAMD2BQ96HH9 432 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HSPB7Q9UBY9 170 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF79Q15937 498 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM128Q5BJH2 165 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LEMD1Q68G75 181 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LYSTQ99698 3801 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RYR2Q92736 4967 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CXorf65A6NEN9 183 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IFNA4P05014 189 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 VAMP1P23763 118 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PMS2P11Q13670 270 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC190Q86UF4 302 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM24BQ8N5W8 94 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SACSQ9NZJ4 4579 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.19□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP14.19□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IL4P05112 153 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RD3LP0DJH9 198 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 STHQ8IWL8 128 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM217Q8N7C4 229 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GATAD1Q8WUU5 269 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DEDD2Q8WXF8 326 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RARRES2Q99969 163 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 U3KQE9 123 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HELTA6NFD8 242 aa14.17□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 K7EQG2 157 aa14.17□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TOMM40O96008 361 aa14.17□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CA1P00915 261 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF688P0C7X2 276 aa14.16□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 INPP1P49441 399 aa14.16□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DHRS2Q13268 280 aa14.16□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C16orf54Q6UWD8 224 aa14.16□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PITX3O75364 302 aa14.15□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SFT2D2O95562 160 aa14.15□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IAPPP10997 89 aa14.15□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PSG1P11464 419 aa14.15□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PPP1R1AQ13522 171 aa14.15□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CENPSQ8N2Z9 138 aa14.15□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LRTM2Q8N967 370 aa14.15□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR11H2Q8NH07 326 aa14.15□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC35E1Q96K37 410 aa14.15□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZFP92A6NM28 416 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MED6O75586 246 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC25A6P12236 298 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RAB11AP62491 216 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GAMTQ14353 236 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR51G1Q8NGK1 321 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DCANP1Q8TF63 244 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GLMPQ8WWB7 406 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SRRQ9GZT4 340 aa14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms