RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-215ENST00000484986 Q6ZRM9 215 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRN-215ENST00000484986 OR4D10Q8NGI6 311 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRN-215ENST00000484986 MARCH1Q8TCQ1 289 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRN-215ENST00000484986 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRN-215ENST00000484986 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRN-215ENST00000484986 U3KQE9 123 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRN-215ENST00000484986 TRAV10A0A0B4J240 114 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRN-215ENST00000484986 KNCNA6PVL3 124 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRN-215ENST00000484986 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
PTPRN-215ENST00000484986 SMIM18P0DKX4 95 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRN-215ENST00000484986 C4BPBP20851 252 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRN-215ENST00000484986 HLA-DMBP28068 263 aa16.05■□□□□ 0.16
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PTPRN-215ENST00000484986 MEF2DQ14814 521 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRN-215ENST00000484986 C2orf83Q53S99 150 aa16.05■□□□□ 0.16
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PTPRN-215ENST00000484986 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
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PTPRN-215ENST00000484986 OR10J1P30954 320 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRN-215ENST00000484986 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
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PTPRN-215ENST00000484986 ETFRF1Q6IPR1 90 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRN-215ENST00000484986 PRSS54Q6PEW0 395 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRN-215ENST00000484986 NOXA1Q86UR1 476 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRN-215ENST00000484986 HERC2O95714 4834 aa16.03■□□□□ 0.16
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PTPRN-215ENST00000484986 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
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PTPRN-215ENST00000484986 C16orf54Q6UWD8 224 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-215ENST00000484986 SLC24A4Q8NFF2 622 aa16.03■□□□□ 0.16
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PTPRN-215ENST00000484986 GLMPQ8WWB7 406 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-215ENST00000484986 RAB40CQ96S21 281 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-215ENST00000484986 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa16.03■□□□□ 0.16
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PTPRN-215ENST00000484986 CTF1Q16619 201 aa16.02■□□□□ 0.16
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PTPRN-215ENST00000484986 GPR107Q5VW38 600 aa16.01■□□□□ 0.15
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PTPRN-215ENST00000484986 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa16.01■□□□□ 0.15
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PTPRN-215ENST00000484986 DISC1C4P0D8 188 aa16■□□□□ 0.15
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PTPRN-215ENST00000484986 TMEM268Q5VZI3 342 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 GPR141Q7Z602 305 aa16■□□□□ 0.15
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PTPRN-215ENST00000484986 RNF126Q9BV68 326 aa16■□□□□ 0.15
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PTPRN-215ENST00000484986 RD3LP0DJH9 198 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 GPR146Q96CH1 333 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 NRN1Q9NPD7 142 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa15.98■□□□□ 0.15
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PTPRN-215ENST00000484986 NPY1RP25929 384 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 NPIPB3Q92617 1050 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa15.98■□□□□ 0.15
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PTPRN-215ENST00000484986 BUB3O43684 328 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 TOMM40O96008 361 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 FAAP20Q6NZ36 180 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 IL22RA2Q969J5 263 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 ACY3Q96HD9 319 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 PRRT1Q99946 306 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 GPR132Q9UNW8 380 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 AMBPP02760 352 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 AKAIN1P0CW23 69 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 SULT1A3P0DMM9 295 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 SULT1A4P0DMN0 295 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 NMSQ5H8A3 153 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 LINC00336Q6ZUF6 198 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 TMEM170AQ8WVE7 144 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 SMIM4Q8WVI0 70 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 MIXL1Q9H2W2 232 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 RABL2BQ9UNT1 228 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 U3KQ87 197 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRN-215ENST00000484986 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRN-215ENST00000484986 H3BMM0 161 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRN-215ENST00000484986 IFNA10P01566 189 aa15.95■□□□□ 0.14
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