RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 NHLH1Q02575 133 aa13.27□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 TBR1Q16650 682 aa13.27□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 OR2Z1Q8NG97 314 aa13.27□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 ST20Q9HBF5 79 aa13.27□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 C2orf70A6NJV1 201 aa13.27□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 GDF5OSQ5U4N7 250 aa13.27□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZR03 302 aa13.27□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 OR9G1Q8NH87 305 aa13.27□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 PKIBQ9C010 78 aa13.27□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 AREGP15514 252 aa13.26□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 FAM201AQ5SY85 155 aa13.26□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 SAMD13Q5VXD3 122 aa13.26□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 OR4S2Q8NH73 311 aa13.26□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 CECR9P0C854 216 aa13.26□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 SMIM21Q3B7S5 101 aa13.26□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM186Q96B77 213 aa13.26□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa13.25□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 RPRMLQ8N4K4 120 aa13.25□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa13.25□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 OR5AL1P0C617 328 aa13.25□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 RHOGP84095 191 aa13.25□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 Q8IYB0 196 aa13.25□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 HCFC1P51610 2035 aa13.25□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa13.25□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 TEX45Q8NA69 505 aa13.25□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 CD5LO43866 347 aa13.24□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 HLA-DRB1P01911 266 aa13.24□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 FXYD7P58549 80 aa13.24□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB108BQ8NET1 73 aa13.24□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 KMT2EQ8IZD2 1858 aa13.24□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 COX7A2P2O60397 106 aa13.24□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 PAX2Q02962 417 aa13.24□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 FAM71F2Q6NXP2 309 aa13.24□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZT83 130 aa13.24□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC29Q8WV35 223 aa13.24□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 C11orf52Q96A22 123 aa13.24□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 CHODLQ9H9P2 273 aa13.24□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF835Q9Y2P0 537 aa13.24□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa13.23□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa13.23□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 DUTP33316 252 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 NMUP48645 174 aa13.23□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 RTL8BQ17RB0 113 aa13.23□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 M0R1B8 84 aa13.23□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 ORM2P19652 201 aa13.23□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM97Q5BJF2 176 aa13.23□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 C5orf17Q8NAS9 161 aa13.23□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa13.23□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 PERPQ96FX8 193 aa13.23□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 COQ2Q96H96 371 aa13.23□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 PLXNB1O43157 2135 aa13.22□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 ZGRF1Q86YA3 2104 aa13.22□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 J3QR06 171 aa13.22□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 SPRY3O43610 288 aa13.22□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 C8orf88P0DMB2 117 aa13.22□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 OR2K2Q8NGT1 345 aa13.22□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 SPRNQ5BIV9 151 aa13.22□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 OR10AG1Q8NH19 301 aa13.22□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 THYN1Q9P016 225 aa13.22□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 SPCS1Q9Y6A9 102 aa13.22□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 LY96Q9Y6Y9 160 aa13.22□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 REG1AP05451 166 aa13.22□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 P0C879 139 aa13.22□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 ERVK11-1P61568 191 aa13.22□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 WFDC3Q8IUB2 231 aa13.22□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 ZNRF1Q8ND25 227 aa13.22□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 HES4Q9HCC6 221 aa13.22□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 MUC6Q6W4X9 2439 aa13.21□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 MORN5Q5VZ52 161 aa13.21□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 WDR82Q6UXN9 313 aa13.21□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 COMMD5Q9GZQ3 224 aa13.21□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa13.21□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 IGLC1P0CG04 106 aa13.21□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 HBBP68871 147 aa13.21□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 FOXE3Q13461 319 aa13.21□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM177Q53S58 311 aa13.21□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 WDR31Q8NA23 367 aa13.21□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 CLUHP3Q96NS8 147 aa13.21□□□□□ -0.29
CCSAP-204ENST00000483092 P01737 135 aa13.21□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 SLC35E4Q6ICL7 350 aa13.21□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PRSS57Q6UWY2 283 aa13.21□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 GRAMD2BQ96HH9 432 aa13.21□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PAXXQ9BUH6 204 aa13.21□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.5 ms