RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481875.1

GARNL3-217, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-217ENST00000481875 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF785A8K8V0 405 aa8.72□□□□□ -1.01
GARNL3-217ENST00000481875 H3BP45 60 aa8.72□□□□□ -1.01
GARNL3-217ENST00000481875 NDUFB8O95169 186 aa8.72□□□□□ -1.01
GARNL3-217ENST00000481875 TRBV12-3P01733 135 aa8.72□□□□□ -1.01
GARNL3-217ENST00000481875 MFAP2P55001 183 aa8.72□□□□□ -1.01
GARNL3-217ENST00000481875 TAS2R30P59541 319 aa8.72□□□□□ -1.01
GARNL3-217ENST00000481875 C2orf83Q53S99 150 aa8.72□□□□□ -1.01
GARNL3-217ENST00000481875 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.72□□□□□ -1.01
GARNL3-217ENST00000481875 NECAP1Q8NC96 275 aa8.72□□□□□ -1.01
GARNL3-217ENST00000481875 ASB13Q8WXK3 278 aa8.72□□□□□ -1.01
GARNL3-217ENST00000481875 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
GARNL3-217ENST00000481875 TUBA4BQ9H853 241 aa8.72□□□□□ -1.01
GARNL3-217ENST00000481875 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa8.72□□□□□ -1.01
GARNL3-217ENST00000481875 DMRT1Q9Y5R6 373 aa8.72□□□□□ -1.01
GARNL3-217ENST00000481875 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.71□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 A0A1B0GVG6 124 aa8.71□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.71□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 E5RGE8 158 aa8.71□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 LGALS9O00182 355 aa8.71□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 CORTO00230 105 aa8.71□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 BMPR1BO00238 502 aa8.71□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 DEDDO75618 318 aa8.71□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 MPC2O95563 127 aa8.71□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 PET100P0DJ07 73 aa8.71□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 CAV2P51636 162 aa8.71□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 PAX9P55771 341 aa8.71□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 DEFA5Q01523 94 aa8.71□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 FGL1Q08830 312 aa8.71□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 C15orf32Q32M92 178 aa8.71□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 BSXQ3C1V8 233 aa8.71□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.71□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 THAP6Q8TBB0 222 aa8.71□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.71□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.7□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 C15orf62A8K5M9 175 aa8.7□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 TSC22D2O75157 780 aa8.7□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM50AO95807 157 aa8.7□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 MT-CO2P00403 227 aa8.7□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 OPRK1P41145 380 aa8.7□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
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GARNL3-217ENST00000481875 GPHB5Q86YW7 130 aa8.7□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.7□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.7□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 CXorf58Q96LI9 332 aa8.7□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 RNF126Q9BV68 326 aa8.7□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 S4R3C0 116 aa8.7□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa8.69□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 H0YIZ8 118 aa8.69□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 CCNKO75909 580 aa8.69□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 IGHV3-23P01764 117 aa8.69□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.69□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 P2RY1P47900 373 aa8.69□□□□□ -1.02
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GARNL3-217ENST00000481875 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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GARNL3-217ENST00000481875 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.69□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 SCARB1Q8WTV0 552 aa8.69□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.69□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 NEURL2Q9BR09 285 aa8.69□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 SLC25A31Q9H0C2 315 aa8.69□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.69□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.69□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 BIRC6Q9NR09 4857 aa8.69□□□□□ -1.02
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GARNL3-217ENST00000481875 IGHV3-48P01763 117 aa8.68□□□□□ -1.02
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GARNL3-217ENST00000481875 MFAP4P55083 255 aa8.68□□□□□ -1.02
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GARNL3-217ENST00000481875 OR8G2PQ6IF36 304 aa8.68□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.68□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 UBAC2Q8NBM4 344 aa8.68□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 OR10P1Q8NGE3 313 aa8.68□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.68□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 MBD2Q9UBB5 411 aa8.68□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.68□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 C2orf70A6NJV1 201 aa8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 A8MWP6 167 aa8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 GGCTO75223 188 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 CST7O76096 145 aa8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 CLEC3BP05452 202 aa8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 FOLR2P14207 255 aa8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 CD81P60033 236 aa8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 Q56UQ5 140 aa8.67□□□□□ -1.02
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