RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472943.5

LINC00886-201, long intergenic non-protein coding RNA 886, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00886, Length 3,306 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00886-201ENST00000472943 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 TNFSF4P23510 183 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 FBLN7Q53RD9 439 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 CGB1A6NKQ9 187 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 M0QZ24 198 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 IGHV3-48P01763 117 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 CD59P13987 128 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 GATA4P43694 442 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 TCF24Q7RTU0 167 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 DEFB108BQ8NET1 73 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 SGK494Q96LW2 274 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 HARBI1Q96MB7 349 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 CCL13Q99616 98 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 OR4C46A6NHA9 309 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 CD24P25063 80 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 ERHP84090 104 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 WT1-ASQ06250 92 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 VHLLQ6RSH7 139 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 DHRS13Q6UX07 377 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 SSX8Q7RTT4 187 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 NPIPB3Q92617 1050 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 RNF7Q9UBF6 113 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 PROCRQ9UNN8 238 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 GPR179Q6PRD1 2367 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 PLAUP00749 431 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 BPIFB3P59826 476 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 HBBP68871 147 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 MLST8Q9BVC4 326 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 C1RLQ9NZP8 487 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 EPDR1Q9UM22 224 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 M0R1B8 84 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 TM4SF5O14894 197 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 THAP8Q8NA92 274 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 GTSF1Q8WW33 167 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 PRO3102Q9H379 93 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 PLCE1Q9P212 2302 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 NCOR1O75376 2440 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 GLRXP35754 106 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 CA7P43166 264 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00886-201ENST00000472943 SVILO95425 2214 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 PLXNB1O43157 2135 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 CDKN1BP46527 198 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 MPV17L2Q567V2 206 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 SMIM12Q96EX1 92 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 LOXL4Q96JB6 756 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 ST20Q9HBF5 79 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 MOSP00540 346 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 TMEM177Q53S58 311 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 LRRC10Q5BKY1 277 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 HES3Q5TGS1 186 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 PDPNQ86YL7 162 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 FDCSPQ8NFU4 85 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 SARAFQ96BY9 339 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 GPR82Q96P67 336 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 hDV102S1A0JD36 115 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 APOA2P02652 100 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 SEM1Q6ZVN7 128 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 OR5AN1Q8NGI8 311 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 BLNKQ8WV28 456 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 PGPA6NDG6 321 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 REG1BP48304 166 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 CCL11P51671 97 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms