RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469717.5

TPM3-215, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TPM3, Length 4,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-215ENST00000469717 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.51□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.51□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 OSTCQ9NRP0 149 aa6.51□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 FZR1Q9UM11 496 aa6.51□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 TCF19Q9Y242 345 aa6.51□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.51□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 C19orf67A6NJJ6 358 aa6.51□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 M0R1X1 148 aa6.51□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 AREGP15514 252 aa6.51□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.51□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 TEX45Q8NA69 505 aa6.51□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 FAM222BQ8WU58 562 aa6.51□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 NABP2Q9BQ15 211 aa6.51□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.51□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.51□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 SMPXQ9UHP9 88 aa6.51□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 HIGD1CA8MV81 97 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 ISLRO14498 428 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 PYYP10082 97 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 GNG5P63218 68 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 JMJD8Q96S16 334 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 PLAUP00749 431 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 REG1AP05451 166 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 CSN3P07498 182 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 CD59P13987 128 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 Q0VFX4 171 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 OR9G1Q8NH87 305 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 MBD6Q96DN6 1003 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 TMEM140Q9NV12 185 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 FAM231BA6NCW3 169 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 MPDU1O75352 247 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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TPM3-215ENST00000469717 PLP2Q04941 152 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 TAAR6Q96RI8 345 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 PKIBQ9C010 78 aa6.5□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 MDP1Q86V88 176 aa6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 TRIB1Q96RU8 372 aa6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 C7orf71A4D174 169 aa6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 SCGB1A1P11684 91 aa6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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TPM3-215ENST00000469717 PRR20CP86479 221 aa6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 PRR20DP86480 221 aa6.49□□□□□ -1.37
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TPM3-215ENST00000469717 ZNF146Q15072 292 aa6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 PLCE1Q9P212 2302 aa6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 C21orf140B9A014 251 aa6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 WISP2O76076 250 aa6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 SP1P08047 785 aa6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 GPR12P47775 334 aa6.49□□□□□ -1.37
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TPM3-215ENST00000469717 CITED1Q99966 193 aa6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 H3BTX0 84 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 IGLC1P0CG04 106 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 RBPJQ06330 500 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 RAB37Q96AX2 223 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.48□□□□□ -1.37
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TPM3-215ENST00000469717 DUSP13Q9UII6 198 aa6.48□□□□□ -1.37
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TPM3-215ENST00000469717 ZZEF1O43149 2961 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 OOEPA6NGQ2 149 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 MT-CO2P00403 227 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 APOA2P02652 100 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 FAM87AP0C7U9 286 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 MAGEA5P43359 124 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 ZNF766Q5HY98 468 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.48□□□□□ -1.37
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