RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 SAR1BQ9Y6B6 198 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 RFX7Q2KHR2 1363 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 HECW2Q9P2P5 1572 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 NBEAQ8NFP9 2946 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 F5H768 121 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 CCRL2O00421 344 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 HSBP1O75506 76 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 SNAP29O95721 258 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 DHFRP00374 187 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 OR8G3PP0DMU2 310 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 CXCL8P10145 99 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 PDE6GP18545 87 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 BGNP21810 368 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 DEFA1P59665 94 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 PSMC5P62195 406 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 EBPQ15125 230 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 ANGPT1Q15389 498 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 GUK1Q16774 197 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 OR10J3Q5JRS4 329 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 HBMQ6B0K9 141 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 DPPA3Q6W0C5 159 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 TERB2Q8NHR7 220 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 MRAP2Q96G30 205 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 SCGB3A1Q96QR1 104 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 DBNDD1Q9H9R9 158 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 EFCAB1Q9HAE3 211 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 DOCK5Q9H7D0 1870 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 TNS3Q68CZ2 1445 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 PKD1L2Q7Z442 2459 aa-1.33□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 CPDO75976 1380 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 GPRASP1Q5JY77 1395 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 TTC41PQ6P2S7 1318 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 DSPPQ9NZW4 1301 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 ACACAQ13085 2346 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 TRAV22A0A0B4J277 110 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 A0A0J9YY10 115 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 A0A1B0GX78 115 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 LRRIQ4A6NIV6 560 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 APOMO95445 188 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 IGLV1-51P01701 117 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 PRM2P04554 102 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 FGF6P10767 208 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 STMN1P16949 149 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 CSKP41240 450 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 CD151P48509 253 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 MAP3K7CLP57077 242 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 HBA1P69905 142 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 SMAGPQ0VAQ4 97 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 CSAG1Q6PB30 78 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 NATD1Q8N6N6 113 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 OR7G1Q8NGA0 311 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 OR5L1Q8NGL2 311 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 OR5D14Q8NGL3 314 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 OR2Y1Q8NGV0 311 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 DTD1Q8TEA8 209 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 PPCDCQ96CD2 204 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 TP53RKQ96S44 253 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 TMBIM4Q9HC24 238 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 BCL2L10Q9HD36 194 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM14BQ9NUH8 114 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 TERF2IPQ9NYB0 399 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 V9GYY9 64 aa-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 GOLGA8OA6NCC3 632 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 MGAT4DA6NG13 374 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 GOLGA8NF8WBI6 632 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 hCG_2039718K7EN88 272 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 CXCL11O14625 94 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 KDELR3O43731 214 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 SULT1C4O75897 302 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 ERC2-IT1O76042 136 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 MT1AP04731 61 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 SRP19P09132 144 aaKnown RBP-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 SPRR1BP22528 89 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 HNMTP50135 292 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 DLX6P56179 175 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 SNAP25P60880 206 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 UBE2KP61086 200 aa-1.35□□□□□ -2.63
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