RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 OR1S2Q8NGQ3 325 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 TRIM63Q969Q1 353 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 RNF183Q96D59 192 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 GRAMD2BQ96HH9 432 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 MS4A6AQ9H2W1 248 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 JTBO76095 146 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 IGKV1-17P01599 117 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 TNFRSF9Q07011 255 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 PRSS54Q6PEW0 395 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 Q8WTZ3 238 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 CSTL1Q9H114 145 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 PRR13Q9NZ81 148 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 HSPB7Q9UBY9 170 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 U3KQ87 197 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 MPTX1A8MV57 137 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 IFNA10P01566 189 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 IGLC1P0CG04 106 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 OR10J1P30954 320 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 RND2P52198 227 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 TIGITQ495A1 244 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 TMEM128Q5BJH2 165 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 LYZL2Q7Z4W2 148 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 LILRB2Q8N423 598 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 TMEM217Q8N7C4 229 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 V9GYH0 126 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-205ENST00000467594 A0A0J9YWU9 116 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 NXPH3O95157 252 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 P2RY1P47900 373 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 TMED4Q7Z7H5 227 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 LYG2Q86SG7 212 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 DTD1Q8TEA8 209 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 GATAD1Q8WUU5 269 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 TMEM170AQ8WVE7 144 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 DEFB131AP59861 70 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 ZNF79Q15937 498 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 ZNF124Q15973 351 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 CCDC190Q86UF4 302 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 OR1S1Q8NH92 325 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 NPIPB3Q92617 1050 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 RBKSQ9H477 322 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 RABAC1Q9UI14 185 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 HELTA6NFD8 242 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 K7EQG2 157 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP11.37□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 SLC25A6P12236 298 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 SPANXN2Q5MJ10 180 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 LRTM2Q8N967 370 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 STXBP6Q8NFX7 210 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 ACY3Q96HD9 319 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 PTTG2Q9NZH5 202 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 U3KQE9 123 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 RYR3Q15413 4870 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 CXorf65A6NEN9 183 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 TOMM40O96008 361 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 IFNA4P05014 189 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 RD3LP0DJH9 198 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 VAMP1P23763 118 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 TENM2Q9NT68 2774 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 DNAH7Q8WXX0 4024 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 NUPR2A6NF83 97 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 FAM90A26D6RGX4 464 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 PITX3O75364 302 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 MED6O75586 246 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 IL4P05112 153 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 LEMD1Q68G75 181 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 C16orf54Q6UWD8 224 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 STHQ8IWL8 128 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 RARRES2Q99969 163 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 PFDN2Q9UHV9 154 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 TMED3Q9Y3Q3 217 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 SFT2D2O95562 160 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 INPP1P49441 399 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 RAB11AP62491 216 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 TMEM41BQ5BJD5 291 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 CENPSQ8N2Z9 138 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 FAM24BQ8N5W8 94 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 DCANP1Q8TF63 244 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 GLMPQ8WWB7 406 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-205ENST00000467594 NAP1L6A6NFF2 107 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 CA1P00915 261 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 FABP1P07148 127 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 PSG1P11464 419 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 RPP30P78346 268 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 DHRS2Q13268 280 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 PMS2P11Q13670 270 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 OR51G1Q8NGK1 321 aa11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.8 ms