RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 CXCL1P09341 107 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 CD99P14209 185 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 CEACAM3P40198 252 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2E1P51965 193 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 LGALS4P56470 323 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 SELENOTP62341 195 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 NDPQ00604 133 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 PAX8Q06710 450 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 RAB31Q13636 194 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-210ENST00000462363 OR51G1Q8NGK1 321 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 OR4F5Q8NH21 305 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 C10orf105Q8TEF2 133 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 C2CD4CQ8TF44 421 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-210ENST00000462363 OR4F4Q96R69 305 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-210ENST00000462363 CTDSP1Q9GZU7 261 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-210ENST00000462363 GGTLC3B5MD39 225 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 C9JCJ5 164 aa4.46□□□□□ -1.7
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PTPRC-210ENST00000462363 REG1AP05451 166 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 IGLC1P0CG04 106 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 C8orf88P0DMB2 117 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP4.46□□□□□ -1.7
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PTPRC-210ENST00000462363 C19orf54Q5BKX5 351 aa4.46□□□□□ -1.7
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PTPRC-210ENST00000462363 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRC-210ENST00000462363 NDUFS8O00217 210 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRC-210ENST00000462363 NDUFB4O95168 129 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRC-210ENST00000462363 TYMSP04818 313 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 GP9P14770 177 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRC-210ENST00000462363 LCN2P80188 198 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 MMDQ15546 238 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRC-210ENST00000462363 TNFRSF19Q9NS68 423 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 HILPDAQ9Y5L2 63 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 CREBBPQ92793 2442 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 VPS13CQ709C8 3753 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 TRAV5A0A0B4J249 113 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 K7EN84 100 aa4.44□□□□□ -1.7
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