RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VDAC1P21796 283 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACTBL2Q562R1 376 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q8N402 240 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR4S2Q8NH73 311 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DUX3Q96PT4 197 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MCUBQ9NWR8 336 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 G3V4G9 280 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNAB3O43448 404 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SOX15O60248 233 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC22A5O76082 557 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AKAIN1P0CW23 69 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LPAR6P43657 344 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FXYD3Q14802 87 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TNXAQ16473 311 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEFB136Q30KP8 78 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SP6Q3SY56 376 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LHFPL1Q86WI0 220 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LFNGQ8NES3 379 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR5T1Q8NG75 326 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARPC1AQ92747 370 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR5B12Q96R08 314 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SRRQ9GZT4 340 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 E7EUB6 86 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 G6PCP35575 357 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LGALS7P47929 136 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PIGPP57054 158 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBE2KP61086 200 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC35B1P78383 322 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CATR1Q13166 79 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRSS8Q16651 343 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF5Q99942 180 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OCR1Q9BZK8 76 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CACNG5Q9UF02 275 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1B0GW64 132 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DISC1C4P0D8 188 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KBTBD11O94819 623 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR2A4O95047 310 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRASP01116 189 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGKV1-39P01597 117 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV3-11P01762 117 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AMBPP02760 352 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRH1P02810 166 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGKV1D-39P04432 117 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 REG1AP05451 166 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBPP20226 339 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 F2RP25116 425 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIR2DS2P43631 304 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR2B8PP59922 312 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MSMO1Q15800 293 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZFP69Q49AA0 526 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TERB2Q8NHR7 220 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SGMS2Q8NHU3 365 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR2A7Q96R45 310 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TP53RKQ96S44 253 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PHB2Q99623 299 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GNB4Q9HAV0 340 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms