RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 BTNL8Q6UX41 500 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR146Q96CH1 333 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 RNF126Q9BV68 326 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 HRH4Q9H3N8 390 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A0G2JRQ6 117 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 CGB1A6NKQ9 187 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 NPIPB5A8MRT5 1133 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 KLK15Q9H2R5 256 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 TMED3Q9Y3Q3 217 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 CRYGCP07315 174 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 PET100P0DJ07 73 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 RHEBQ15382 184 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 Q6ZRM9 215 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 HINT2Q9BX68 163 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 IGLC7A0M8Q6 106 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 C5orf51A6NDU8 294 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 TRGV3P03979 118 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 AREGP15514 252 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 NMSQ5H8A3 153 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 MS4A10Q96PG2 267 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 CACNG5Q9UF02 275 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1B0GU03 582 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1W2PRX2 142 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 A8MWP6 167 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 ST8SIA3O43173 380 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 TPPP2P59282 170 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 PRCDQ00LT1 54 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 GAMTQ14353 236 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 OR52E5Q8NH55 327 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A0G2JLM5 398 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 H0YIZ8 118 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 TSPAN15O95858 294 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 OR13C7P0DN81 318 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC25A6P12236 298 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 FGF7P21781 194 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 RPP30P78346 268 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 USMG5Q96IX5 58 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 OR4F4Q96R69 305 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP1R2P9O14990 202 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 CYB5BO43169 146 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 DLEU1O43261 78 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 IFNA21P01568 189 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 DEFA4P12838 97 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 ERHP84090 104 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 WT1-ASQ06250 92 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 KLK9Q2XQG4 91 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 ENY2Q9NPA8 101 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM223BA6NKX1 122 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 C9JQL5 133 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 GGCTO75223 188 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 YIF1AO95070 293 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 REG1AP05451 166 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 GGNBP1Q5YKI7 109 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 OR2C3Q8N628 320 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 NECAP1Q8NC96 275 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 PRH1P02810 166 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 RHOGP84095 191 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 IFITM10A6NMD0 228 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 PITX3O75364 302 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 G0S2P27469 103 aa8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms