RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 P2RY1P47900 373 aa11.13□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 TMBIM6P55061 237 aa11.13□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 MLANAQ16655 118 aa11.13□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 LEMD1Q68G75 181 aa11.13□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 OR51S1Q8NGJ8 323 aa11.13□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 OR1S2Q8NGQ3 325 aa11.13□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 LHFPL5Q8TAF8 219 aa11.13□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 IL22RA2Q969J5 263 aa11.13□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 GPR146Q96CH1 333 aa11.13□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa11.13□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa11.12□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 HELTA6NFD8 242 aa11.12□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 IGKV1-17P01599 117 aa11.12□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 IFNA4P05014 189 aa11.12□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 SULT1A3P0DMM9 295 aa11.12□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 SULT1A4P0DMN0 295 aa11.12□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 RND2P52198 227 aa11.12□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 TIGITQ495A1 244 aa11.12□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 TMEM41BQ5BJD5 291 aa11.12□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 C11orf45Q8TAV5 145 aa11.12□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 BIRC6Q9NR09 4857 aa11.12□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa11.11□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 K7EQG2 157 aa11.11□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 OR10J1P30954 320 aa11.11□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 PRSS54Q6PEW0 395 aa11.11□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa11.11□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 MCUBQ9NWR8 336 aa11.11□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 IFNA10P01566 189 aa11.1□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP11.1□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 IGLC1P0CG04 106 aa11.1□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 SPP1P10451 314 aa11.1□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 ANXA3P12429 323 aa11.1□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 NPY1RP25929 384 aa11.1□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 SRPXP78539 464 aa11.1□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 FAM24BQ8N5W8 94 aa11.1□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 U3KQ87 197 aa11.1□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 A0A0B4J2A0 478 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 FABP12A6NFH5 140 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 ZNF688P0C7X2 276 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 AKR1C4P17516 323 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 FAUP35544 74 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 CCR6P51684 374 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 DHRS2Q13268 280 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 SHPKQ9UHJ6 478 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 PFDN2Q9UHV9 154 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-206ENST00000431413 ALMS1Q8TCU4 4167 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 NXPH3O95157 252 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 IL4P05112 153 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 RD3LP0DJH9 198 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 SMCO1Q147U7 214 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 NMSQ5H8A3 153 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 LGI3Q8N145 548 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 CENPSQ8N2Z9 138 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 DCANP1Q8TF63 244 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 NPIPB3Q92617 1050 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 ACY3Q96HD9 319 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 FBXL17Q9UF56 701 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 U3KQE9 123 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 TNFSF8P32971 234 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 AP3S2P59780 193 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 C16orf54Q6UWD8 224 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 DTD1Q8TEA8 209 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 HSPB7Q9UBY9 170 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 TOMM40O96008 361 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 TCTAP57738 103 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 ACTL10Q5JWF8 245 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 LGALS9CQ6DKI2 356 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 LYZL2Q7Z4W2 148 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 OR1S1Q8NH92 325 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 MCFD2Q8NI22 146 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 C2CD4CQ8TF44 421 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 TMEM170AQ8WVE7 144 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 GLMPQ8WWB7 406 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 KNCNA6PVL3 124 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 C11orf94C9JXX5 98 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 DEFB4AO15263 64 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 FABP1P07148 127 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 MIFP14174 115 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 PSMG4Q5JS54 123 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 OR51G1Q8NGK1 321 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa11.05□□□□□ -0.64
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