RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLRD1Q13241 179 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM116Q8NCL8 245 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR10G8Q8NGN5 311 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C22orf15Q8WYQ4 148 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HELTA6NFD8 242 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ODF3BA8MYP8 253 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRTN3P24158 256 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LGALS4P56470 323 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAX2Q02962 417 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLGLAQ15195 96 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HILPDAQ9Y5L2 63 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FABP4P15090 132 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDKN1AP38936 164 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CEACAM3P40198 252 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACTL10Q5JWF8 245 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNLZQ5SXM8 178 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM183AQ8IXX5 376 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CFHR4Q92496 578 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRGV9Q99603 122 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PYYP10082 97 aa14.92□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UQCRFS1P47985 274 aa14.92□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GNG4P50150 75 aa14.92□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MMDQ15546 238 aa14.92□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CENPWQ5EE01 88 aa14.92□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDPF1Q6NVV7 123 aa14.92□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.92□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HIST1H2BLQ99880 126 aa14.92□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa14.91□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC00305Q7Z4B0 112 aa14.91□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BTF3L4Q96K17 158 aa14.91□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAXXQ9BUH6 204 aa14.91□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDUFS7O75251 213 aa14.91□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NBR2O15453 112 aa14.9□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0U1RQK1 487 aa14.89□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF320A2RRD8 509 aa14.89□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A6NNC1 897 aa14.89□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ORM2P19652 201 aa14.89□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR1B1Q8NGR6 318 aa14.89□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBTD1Q9HAC8 227 aa14.89□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XKRY2A2RUG3 117 aa14.89□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa14.89□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.89□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FXYD5Q96DB9 178 aa14.89□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PERPQ96FX8 193 aa14.89□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1W2PRD5 423 aa14.88□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1W2PRF3 423 aa14.88□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1W2PRM7 423 aa14.88□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNIH1O95406 144 aa14.88□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDLIM4P50479 330 aa14.88□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPL15P61313 204 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR5I1Q13606 314 aa14.88□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIR3DL3Q8N743 410 aa14.88□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL36BQ9NZH7 164 aa14.88□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC17A3O00476 420 aa14.88□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDUFA3O95167 84 aa14.88□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GNLYP22749 145 aa14.88□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD24P25063 80 aa14.88□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VMO1Q7Z5L0 202 aa14.88□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPBQ8NG41 125 aa14.88□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.88□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 I3L2K1 104 aa14.87□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERVFC1-1P60608 527 aa14.87□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TIGITQ495A1 244 aa14.87□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.87□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AMBPP02760 352 aa14.86□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBLN7Q53RD9 439 aa14.86□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STXBP6Q8NFX7 210 aa14.86□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRDM13Q9H4Q3 707 aa14.86□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 V9GYV3 84 aa14.86□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.86□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C19orf84I3L1E1 186 aa14.86□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HYPMO75409 117 aa14.86□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGLV2-8P01709 118 aa14.86□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGLC1P0CG04 106 aa14.86□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLP1P60201 277 aa14.86□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HES1Q14469 280 aa14.86□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SSX2Q16385 188 aa14.86□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF329Q86UD4 541 aa14.86□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa14.85□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EFNA4P52798 201 aa14.85□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa14.85□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GCGP01275 180 aa14.85□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FXYD3Q14802 87 aa14.85□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa14.85□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DYNAPQ8N1N2 210 aa14.85□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa14.85□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C5orf64Q2M2E5 130 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms