RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422770.5

HERC3-204, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-204ENST00000422770 CLINT1Q14677 625 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-204ENST00000422770 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-204ENST00000422770 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-204ENST00000422770 OR1L6Q8NGR2 347 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-204ENST00000422770 SMIM8Q96KF7 97 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-204ENST00000422770 HYLS1Q96M11 299 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-204ENST00000422770 RNF126Q9BV68 326 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-204ENST00000422770 MFFQ9GZY8 342 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-204ENST00000422770 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-204ENST00000422770 FBXL17Q9UF56 701 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-204ENST00000422770 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-204ENST00000422770 NOTCH1P46531 2555 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 IGHV3-48P01763 117 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 CLEC3BP05452 202 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 CXCL2P19875 107 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 MFAP2P55001 183 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 BAXQ07812 192 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 ZNF114Q8NC26 417 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 OR1S2Q8NGQ3 325 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 OR1P1Q8NH06 330 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 AQP10Q96PS8 301 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 HMSDA8MTL9 139 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 TGOLN2O43493 480 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 BCL2L11O43521 198 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 GP9P14770 177 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 OPRK1P41145 380 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 SULT1A1P50225 295 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 HBG1P69891 147 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 HBG2P69892 147 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 AKR1C1Q04828 323 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 CD69Q07108 199 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 OR2F1Q13607 317 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 ZNF345Q14585 488 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 BSXQ3C1V8 233 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 C2orf83Q53S99 150 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 VN1R17PQ8TDU5 208 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 SLC35E1Q96K37 410 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 C20orf24Q9BUV8 137 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 ARL6Q9H0F7 186 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 U3KQ87 197 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 MT-CO2P00403 227 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 EDN2P20800 178 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 MFAP4P55083 255 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 ARL16Q0P5N6 197 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 GUCA2BQ16661 112 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 LCN12Q6JVE5 192 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 TMUB2Q71RG4 321 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 KCNRGQ8N5I3 272 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 PPP1R14BQ96C90 147 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 ACY3Q96HD9 319 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 TMEM147Q9BVK8 224 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 TGP01266 2768 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 C2orf70A6NJV1 201 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 K7EIM0 57 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 CORTO00230 105 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 GNG7O60262 68 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 YIF1AO95070 293 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 IGLV1-51P01701 117 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 CSN3P07498 182 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 FOLR2P14207 255 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 NHLH2Q02577 135 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 TM4SF20Q53R12 229 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 OR10P1Q8NGE3 313 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 ATP5SQ99766 215 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 SORL1Q92673 2214 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 A0A0D9SG52 128 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 DFFBO76075 338 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 C4BPBP20851 252 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 S100A11P31949 105 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 RND2P52198 227 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 DLK1P80370 383 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-204ENST00000422770 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.35□□□□□ -1.23
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