RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 CYCSP99999 105 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa22.88■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa22.88■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa22.87■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM213A2RRL7 107 aa22.87■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 C2orf70A6NJV1 201 aa22.87■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 CCNKO75909 580 aa22.87■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 METTL15P1P0C7V9 234 aa22.87■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 KRTAP10-11P60412 298 aa22.87■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 TM4SF20Q53R12 229 aa22.87■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 CHAC2Q8WUX2 184 aa22.87■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa22.86■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa22.86■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 TIGITQ495A1 244 aa22.86■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 HAPLN4Q86UW8 402 aa22.86■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 OR10J1P30954 320 aa22.85■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 OR8G2PQ6IF36 304 aa22.85■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 SLC35E1Q96K37 410 aa22.85■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 UFC1Q9Y3C8 167 aa22.85■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 YIF1AO95070 293 aa22.84■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 FOLR2P14207 255 aa22.84■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF600Q6ZNG1 722 aa22.84■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 C20orf24Q9BUV8 137 aa22.84■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 DEDDO75618 318 aa22.84■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 IGLV1-51P01701 117 aa22.84■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 CBLN1P23435 193 aa22.84■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 BCAP31P51572 246 aa22.84■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 ELLP55199 621 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa22.84■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 OR1S2Q8NGQ3 325 aa22.84■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 TOMM20LQ6UXN7 152 aa22.83■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa22.83■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa22.83■■□□□ 1.25
PKDCC-202ENST00000401498 FAM24AA6NFZ4 105 aa22.82■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 H0YIZ8 118 aa22.82■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 SCGB2A1O75556 95 aa22.82■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 GIPP09681 153 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 CAV2P51636 162 aa22.82■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 ARL16Q0P5N6 197 aa22.82■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 ZFAND3Q9H8U3 227 aa22.81■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa22.8■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 K7EMT4 169 aa22.8■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 C8orf88P0DMB2 117 aa22.8■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 OR10P1Q8NGE3 313 aa22.8■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 ASB13Q8WXK3 278 aa22.8■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 OR5AC2Q9NZP5 309 aa22.8■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa22.8■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 RLN2P04090 185 aa22.79■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 MARC2Q969Z3 335 aa22.79■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 SORL1Q92673 2214 aa22.79■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 ZFP92A6NM28 416 aa22.78■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 RAP2BP61225 183 aa22.78■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 DEFA6Q01524 100 aa22.78■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 RNF126Q9BV68 326 aa22.78■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 IGSF23A1L1A6 192 aa22.77■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 CST7O76096 145 aa22.77■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 MPC2O95563 127 aa22.77■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 DLK1P80370 383 aa22.77■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM252Q8N6L7 170 aa22.77■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 THAP8Q8NA92 274 aa22.77■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 MLXQ9UH92 298 aa22.77■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 SELENOKQ9Y6D0 94 aa22.77■■□□□ 1.24
PKDCC-202ENST00000401498 E5RGE8 158 aa22.76■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF90Q03938 601 aa22.76■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 DEFB114Q30KQ6 69 aa22.76■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 Q8WTZ3 238 aa22.76■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 AKR1C1Q04828 323 aa22.76■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 Q5BKY6 102 aa22.76■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 DYNLRB2Q8TF09 96 aa22.76■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa22.75■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 TOMM40O96008 361 aa22.75■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 RD3LP0DJH9 198 aa22.75■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 PSG1P11464 419 aa22.75■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM144Q7Z5S9 345 aa22.75■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 TRGV9Q99603 122 aa22.75■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 GINS3Q9BRX5 216 aa22.75■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 SMCO3A2RU48 225 aa22.74■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 IZUMO1RA6ND01 250 aa22.74■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 FNDC10F2Z333 226 aa22.74■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 SULT1A1P50225 295 aa22.74■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 ST6GAL2Q96JF0 529 aa22.74■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 SMPXQ9UHP9 88 aa22.74■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 G3V3Q6 166 aa22.73■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 P2RY1P47900 373 aa22.73■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 BTNL8Q6UX41 500 aa22.73■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM217Q8N7C4 229 aa22.73■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 GGACTQ9BVM4 153 aa22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms