RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 IGSF23A1L1A6 192 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 VWC2LB2RUY7 222 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TOMM40O96008 361 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 CAMPP49913 170 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 CATR1Q13166 79 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 C8orf31Q8N9H6 132 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 C20orf144Q9BQM9 153 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 NMES1Q9C002 83 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 KIAA1456Q9P272 454 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TCF19Q9Y242 345 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 LINC00473A8K010 186 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 WIPF1O43516 503 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 NDUFB8O95169 186 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP10-9P60411 292 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 LMO4P61968 165 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TDRG1Q3Y452 100 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ACSM6Q6P461 480 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 C2orf50Q96LR7 162 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TMEM133Q9H2Q1 129 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 CUBNO60494 3623 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 H3BQ15 152 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 J3QLI3 93 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 M0R1X1 148 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 PROP1O75360 226 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 DUTP33316 252 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 POU2AF1Q16633 256 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TMEM217Q8N7C4 229 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ZDHHC16Q969W1 377 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ZNRD1Q9P1U0 126 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 NAT8Q9UHE5 227 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 INSIG2Q9Y5U4 225 aa4.92□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 J3QR06 171 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 IGKV1-39P01597 117 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 IGKV1D-39P04432 117 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 DSCR9P59020 149 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 LINC00205P59089 165 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ABHD12Q8N2K0 398 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 LINC00311Q8N616 119 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 Q8N7P7 452 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 LFNGQ8NES3 379 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 MAP1LC3AQ9H492 121 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TMED3Q9Y3Q3 217 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 M0R1W7 72 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 LPAR6P43657 344 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 REG1BP48304 166 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 KIR3DL3Q8N743 410 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TMEM189A5PLL7 270 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 UMAD1C9J7I0 102 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 PRTN3P24158 256 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 RPS20P60866 119 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 C1QL4Q86Z23 238 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 OR9G1Q8NH87 305 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 SMIM8Q96KF7 97 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 UHRF2Q96PU4 802 aa4.91□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 FAM208BQ5VWN6 2430 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 C7orf71A4D174 169 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 H7BYZ3 331 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 KIR2DS2P43631 304 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 DLX1P56177 255 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 IL15RAQ13261 267 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 NMSQ5H8A3 153 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 DPPA3Q6W0C5 159 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TMEM183AQ8IXX5 376 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 MRAPQ8TCY5 172 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 DDB2Q92466 427 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 FRZBQ92765 325 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 S1PR3Q99500 378 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 FBN2P35556 2912 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 GAGE12JA6NER3 117 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 FOXH1O75593 365 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 GAGE7O76087 117 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 GAGE12FP0CL80 117 aa4.9□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.2 ms