RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMB3P49720 205 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 HAGHQ16775 308 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXC2Q99958 501 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 GNG13Q9P2W3 67 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.98□□□□□ -1.133e-7■■■■■ 51.1
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RABGGTB-201ENST00000319942 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 TAS2R45P59539 299 aa7.97□□□□□ -1.13
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RABGGTB-201ENST00000319942 OR5T1Q8NG75 326 aa7.97□□□□□ -1.13
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RABGGTB-201ENST00000319942 PFDN5Q99471 154 aa7.97□□□□□ -1.13
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RABGGTB-201ENST00000319942 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 VAX2Q9UIW0 290 aa7.97□□□□□ -1.13
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RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.96□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 A6NDX4 124 aa7.96□□□□□ -1.13
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RABGGTB-201ENST00000319942 CLN5O75503 358 aa7.96□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 STAG3L2P0CL84 134 aa7.96□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 STAG3L3P0CL85 134 aa7.96□□□□□ -1.13
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RABGGTB-201ENST00000319942 MFAP4P55083 255 aa7.96□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 LY6EQ16553 131 aa7.96□□□□□ -1.13
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RABGGTB-201ENST00000319942 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.96□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM219Q86XT9 240 aa7.96□□□□□ -1.13
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RABGGTB-201ENST00000319942 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.96□□□□□ -1.13
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RABGGTB-201ENST00000319942 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.95□□□□□ -1.14
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RABGGTB-201ENST00000319942 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.94□□□□□ -1.14
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RABGGTB-201ENST00000319942 GNG7O60262 68 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 OR5G3P0C626 314 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 RD3LP0DJH9 198 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 C8orf88P0DMB2 117 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 ICAM4Q14773 271 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 ECSCRQ19T08 205 aa7.94□□□□□ -1.14
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RABGGTB-201ENST00000319942 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 SUN5Q8TC36 379 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
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