RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.39□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 TOMM5Q8N4H5 51 aa7.39□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 FCAMRQ8WWV6 532 aa7.39□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 MISP3Q96FF7 219 aa7.39□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 ABHD1Q96SE0 405 aa7.39□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 ATG101Q9BSB4 218 aa7.39□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 ATG5Q9H1Y0 275 aa7.39□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.39□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 OR51B2Q9Y5P1 312 aa7.39□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.38□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 MT-CO2P00403 227 aa7.38□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 PPYP01298 95 aa7.38□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 NPBWR1P48145 328 aa7.38□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 SNX29P2Q8IUI4 249 aa7.38□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 DCANP1Q8TF63 244 aa7.38□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 RAB40CQ96S21 281 aa7.38□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 XCL2Q9UBD3 114 aa7.38□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 DKK2Q9UBU2 259 aa7.38□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 PRNDQ9UKY0 176 aa7.38□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 RFNGQ9Y644 331 aa7.38□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 FCGR2CP31995 323 aa7.37□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 BCAP31P51572 246 aa7.37□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 EMP1P54849 157 aa7.37□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.37□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 AADACL3Q5VUY0 350 aa7.37□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.37□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 ZNF114Q8NC26 417 aa7.37□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 OR51H1Q8NH63 302 aa7.37□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.37□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7.37□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 MOB3AQ96BX8 217 aa7.37□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 METTL26Q96S19 204 aa7.37□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 SLC5A7Q9GZV3 580 aa7.37□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 MTFP1Q9UDX5 166 aa7.37□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 A0A1B0GVG6 124 aa7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 HELTA6NFD8 242 aa7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 PLA2G10O15496 165 aa7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 PFDN1O60925 122 aa7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 HTN3P15516 51 aa7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 TBPP20226 339 aa7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 F2RP25116 425 aa7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 CRYBB3P26998 211 aa7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 PRSS3P35030 304 aa7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 P2RY1P47900 373 aa7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 RFX2P48378 723 aa7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 GNG2P59768 71 aa7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 PSMG4Q5JS54 123 aa7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 GPX8Q8TED1 209 aa7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 NSG2Q9Y328 171 aa7.36□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 TMEM235A6NFC5 223 aa7.35□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 H3BMM0 161 aa7.35□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 KRASP01116 189 aa7.35□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 IGHV3-48P01763 117 aa7.35□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 GNRHRP30968 328 aa7.35□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 RCVRNP35243 200 aa7.35□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 CBX5P45973 191 aa7.35□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 TAS2R19P59542 299 aa7.35□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 DHRS2Q13268 280 aa7.35□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 BEST4Q8NFU0 473 aa7.35□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 OR52I2Q8NH67 350 aa7.35□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.35□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 AUNIPQ9H7T9 357 aa7.35□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 TRAV18A0A075B6X5 111 aa7.34□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 A0A1B0GU03 582 aa7.34□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 SSX5O60225 188 aa7.34□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 SCGB2A1O75556 95 aa7.34□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 TMEM50AO95807 157 aa7.34□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 AKAIN1P0CW23 69 aa7.34□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 CCL18P55774 89 aa7.34□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 FXYD4P59646 89 aa7.34□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 ERHP84090 104 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 GSG1LQ6UXU4 331 aa7.34□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 TMEM229BQ8NBD8 167 aa7.34□□□□□ -1.23
USP41-201ENST00000292729 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.33□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 CORTO00230 105 aa7.33□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 PRAF2O60831 178 aa7.33□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 HLA-DRB4P13762 266 aa7.33□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 G6PCP35575 357 aa7.33□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 LPAR6P43657 344 aa7.33□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 KRTAP10-2P60368 255 aa7.33□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 DAD1P61803 113 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms