RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 CACNG7P62955 275 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 WDR82Q6UXN9 313 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 SMRP1Q8NCR6 262 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC29Q8WV35 223 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 ASCL2Q99929 193 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 PROK2Q9HC23 129 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 SP1P08047 785 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 TIMM23BQ5SRD1 257 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 MDP1Q86V88 176 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1W2PPM0 123 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 C21orf140B9A014 251 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 CCL7P80098 99 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 SLC25A45Q8N413 288 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF503Q96F45 646 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 COQ2Q96H96 371 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 GAGE12HA6NDE8 117 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 SMIM13P0DJ93 91 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 PDPNQ86YL7 162 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 ACP1P24666 158 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 ETDBQ3ZM63 59 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 SLC35E4Q6ICL7 350 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 SPINK14Q6IE38 97 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 Q8TCH9 128 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 RNF138Q8WVD3 245 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 C18orf15Q96N68 181 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 COL4A2P08572 1712 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 VWC2LB2RUY7 222 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 TBC1D28Q2M2D7 210 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 FAM120AOSQ5T036 256 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 GPR179Q6PRD1 2367 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 F2RL2O00254 374 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 CELA3AP09093 270 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 C1orf159Q96HA4 380 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 SLC25A33Q9BSK2 321 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 CEP250Q9BV73 2442 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 PLXNB1O43157 2135 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1W2PR77 199 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 CRYBA4P53673 196 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 NXPH1P58417 271 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 PRR20EP86478 221 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 PRR20CP86479 221 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 PRR20DP86480 221 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 PRR20BP86481 221 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 PRR20AP86496 221 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 UFSP1Q6NVU6 142 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 RASL11AQ6T310 242 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 PCP2Q8IVA1 136 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 STXBP6Q8NFX7 210 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 RND1Q92730 232 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 APELAP0DMC3 54 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 EXPH5Q8NEV8 1989 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 DNPH1O43598 174 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 OR2J3O76001 311 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 FAM87AP0C7U9 286 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 ZADH2Q8N4Q0 377 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 LOXL2Q9Y4K0 774 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 hADV38S2A0JD32 116 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 FTH1P19P0C7X4 201 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 B3GALT5-AS1P59052 145 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 WFDC2Q14508 124 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 AMTNQ6UX39 209 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 PRNTQ86SH4 94 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 TANC2Q9HCD6 1990 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 MOSP00540 346 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 SP9P0CG40 484 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 ATP5G2Q06055 141 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 ARPC1AQ92747 370 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 MBD6Q96DN6 1003 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 C1RLQ9NZP8 487 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 PSMB11A5LHX3 300 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF146Q15072 292 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRR-201ENST00000283228 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms