RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 LGALS7P47929 136 aa8.75□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 MFAP2P55001 183 aa8.75□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.75□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 OR5B3Q8NH48 314 aa8.75□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 P2RX4Q99571 388 aa8.75□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 MGST2Q99735 147 aa8.75□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 CEACAM3P40198 252 aa8.75□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 RAB11AP62491 216 aa8.75□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 SPSB3Q6PJ21 355 aa8.75□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 VSTM2AQ8TAG5 236 aa8.75□□□□□ -1.01
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GGPS1-201ENST00000282841 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa8.75□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 AKAP9Q99996 3911 aa8.75□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 RAB5AP20339 215 aa8.75□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
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GGPS1-201ENST00000282841 TNFRSF19Q9NS68 423 aa8.75□□□□□ -1.01
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GGPS1-201ENST00000282841 FABP4P15090 132 aa8.74□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 OPRK1P41145 380 aa8.74□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF709Q8N972 641 aa8.74□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 FKBP11Q9NYL4 201 aa8.74□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 A0A0U1RQK1 487 aa8.74□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa8.74□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 C20orf202A1L168 122 aa8.74□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 ZFP92A6NM28 416 aa8.74□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 NPFFO15130 113 aa8.74□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 UBE2E1P51965 193 aa8.74□□□□□ -1.01
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GGPS1-201ENST00000282841 LY6EQ16553 131 aa8.74□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 GNG13Q9P2W3 67 aa8.74□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 LINC01548A6NM66 108 aa8.73□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 M0QZ24 198 aa8.73□□□□□ -1.01
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GGPS1-201ENST00000282841 MSMBP08118 114 aa8.73□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 PTTG1IPP53801 180 aa8.73□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 CD81P60033 236 aa8.73□□□□□ -1.01
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GGPS1-201ENST00000282841 ATP6V1FQ16864 119 aa8.73□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 KHDC3LQ587J8 217 aa8.73□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.73□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.73□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.73□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.73□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.73□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 LINC00527Q9UJ94 153 aa8.73□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.73□□□□□ -1.01
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GGPS1-201ENST00000282841 PAX8Q06710 450 aa8.73□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 GUK1Q16774 197 aa8.73□□□□□ -1.01
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GGPS1-201ENST00000282841 KIR3DL3Q8N743 410 aa8.73□□□□□ -1.01
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GGPS1-201ENST00000282841 DOK5Q9P104 306 aa8.73□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 TEX22C9J3V5 150 aa8.72□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 SCGB2A2Q13296 93 aa8.72□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 FXYD3Q14802 87 aa8.72□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 DNLZQ5SXM8 178 aa8.72□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.72□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 NPIPB3Q92617 1050 aa8.72□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.72□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 SFTA3P0C7M3 94 aa8.72□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF90Q03938 601 aa8.72□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.72□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 KIAA1456Q9P272 454 aa8.72□□□□□ -1.01
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GGPS1-201ENST00000282841 PRSS57Q6UWY2 283 aa8.71□□□□□ -1.01
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GGPS1-201ENST00000282841 OR2T10Q8NGZ9 312 aa8.71□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 Q96MF0 132 aa8.71□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 HSPB9Q9BQS6 159 aa8.71□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.71□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.71□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 NPVFQ9HCQ7 196 aa8.71□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.71□□□□□ -1.01
GGPS1-201ENST00000282841 MDKP21741 143 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GGPS1-201ENST00000282841 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.71□□□□□ -1.02
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.71□□□□□ -1.02
GGPS1-201ENST00000282841 TEPPQ6URK8 271 aa8.71□□□□□ -1.02
GGPS1-201ENST00000282841 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GGPS1-201ENST00000282841 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
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