RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 LINC01619G3V211 115 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 IGKV3-15P01624 115 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 TCF24Q7RTU0 167 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 TMEM160Q9NX00 188 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 COX11Q9Y6N1 276 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 IGHV3-11P01762 117 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 ZNF415Q09FC8 603 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 ZNF479Q96JC4 524 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 RTN4RQ9BZR6 473 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.53□□□□□ -1.36
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USP3-201ENST00000268049 IL11P20809 199 aa6.52□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.52□□□□□ -1.36
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USP3-201ENST00000268049 SOSTQ9BQB4 213 aa6.52□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 PRSS8Q16651 343 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 ATP6V0BQ99437 205 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 ZIC3O60481 467 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 MALP21145 153 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 HSD52Q0P140 79 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 DEPPQ9NTK1 212 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 ALPK3Q96L96 1907 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 RNF222A6NCQ9 220 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 OVOL1O14753 267 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 ZNHIT1O43257 154 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 NPSP0C0P6 89 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 CGB7P0DN87 165 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.52□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 DSPPQ9NZW4 1301 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 NBASA2RRP1 2371 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 C1QCP02747 245 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 ADMP35318 185 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 GZMMP51124 257 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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USP3-201ENST00000268049 A8MWP6 167 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 GHRHP01286 108 aa6.51□□□□□ -1.37
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USP3-201ENST00000268049 OR5P3Q8WZ94 311 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 IGHV1-69P01742 117 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 IGHV2-70P01814 119 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 GAGE1Q13065 139 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 DRAM1Q8N682 238 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.51□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 CENPWQ5EE01 88 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 HCP5Q6MZN7 132 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.5□□□□□ -1.37
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USP3-201ENST00000268049 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.5□□□□□ -1.37
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USP3-201ENST00000268049 LHBP01229 141 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 IGHV1-46P01743 117 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 RNF5Q99942 180 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 DAD1P61803 113 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 FAM223BA6NKX1 122 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 OR9G9P0C7N8 305 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 FSTP19883 344 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 SFTA2Q6UW10 78 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 AQP3Q92482 292 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 FBXL15Q9H469 300 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-201ENST00000268049 RRHO14718 337 aa6.49□□□□□ -1.37
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