RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM57B	Q71RH2	274 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072		U3KQE9	123 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	ARID2	Q68CP9	1835 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	GP9	P14770	177 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	MYOD1	P15172	320 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	NTF4	P34130	210 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	FOXI1	Q12951	378 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	MMD2	Q8IY49	270 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	COX8A	P10176	69 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	LIF	P15018	202 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	C4orf45	Q96LM5	186 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	OR10A2	Q9H208	303 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	SERF2	P84101	59 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	RTL8B	Q17RB0	113 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	WDR38	Q5JTN6	314 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	THAP8	Q8NA92	274 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	APOO	Q9BUR5	198 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	HBG1	P69891	147 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	HBG2	P69892	147 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	AMTN	Q6UX39	209 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	RABAC1	Q9UI14	185 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	CDSN	Q15517	529 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	DEPP	Q9NTK1	212 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	PROCR	Q9UNN8	238 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	EPPIN	O95925	133 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	FCER1G	P30273	86 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	CLDN17	P56750	224 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	CTXN1	P60606	82 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	BMF	Q96LC9	184 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	NCKAP5	O14513	1909 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	OVOL1	O14753	267 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	LYZL6	O75951	148 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	EFEMP1	Q12805	493 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	BORCS8	Q96FH0	119 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
NECAP1-222	ENST00000640072	PTGDS	P41222	190 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NECAP1-222	ENST00000640072	NMU	P48645	174 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NECAP1-222	ENST00000640072	UBE2E1	P51965	193 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NECAP1-222	ENST00000640072	CX3CL1	P78423	397 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM201A	Q5SY85	155 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NECAP1-222	ENST00000640072	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NECAP1-222	ENST00000640072	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NECAP1-222	ENST00000640072	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NECAP1-222	ENST00000640072	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NECAP1-222	ENST00000640072	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NECAP1-222	ENST00000640072	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NECAP1-222	ENST00000640072	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
NECAP1-222	ENST00000640072	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
NECAP1-222	ENST00000640072	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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