RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629219.1

PKP4-218, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-218ENST00000629219 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 MISP3Q96FF7 219 aa6.78□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.78□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 SMPXQ9UHP9 88 aa6.78□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.78□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 A0A0B4J2A0 478 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 UBE2CO00762 179 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 CHEK1O14757 476 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 CLN5O75503 358 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 SLC25A4P12235 298 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 ANXA3P12429 323 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 S100A5P33763 92 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 TMEM187Q14656 261 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 C2orf83Q53S99 150 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 NMSQ5H8A3 153 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 CASC10Q5T4H9 136 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 Q6ZRM9 215 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 CCDC190Q86UF4 302 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 DEFB125Q8N687 156 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 TMEM230Q96A57 120 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 VSIRQ9H7M9 311 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 V9GYH0 126 aa6.77□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 TMEM50AO95807 157 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 SLC25A6P12236 298 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 LYL1P12980 280 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 CCR6P51684 374 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 ZNF79Q15937 498 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 Q6ZWC4 215 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 LRTM2Q8N967 370 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 CACNG5Q9UF02 275 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 A0A1B0GU03 582 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 A0A1W2PS18 150 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 DFFBO76075 338 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 OPRK1P41145 380 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 APOC4P55056 127 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 LGI3Q8N145 548 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 GPR146Q96CH1 333 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 MCUBQ9NWR8 336 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 U3KQ87 197 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 NPY1RP25929 384 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 CRYBB3P26998 211 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 PAFAH1B2P68402 229 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 TNFRSF9Q07011 255 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 SMCO1Q147U7 214 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 PYDC2Q56P42 97 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 SPINK9Q5DT21 86 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 RNF2Q99496 336 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 CCDC160A6NGH7 325 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 PITX3O75364 302 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 YIF1AO95070 293 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 IGKV1-17P01599 117 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 IGLC1P0CG04 106 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.73□□□□□ -1.33
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