RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 AADACP22760 399 aa9.16□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 CEACAM3P40198 252 aa9.16□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 CLRN1P58418 232 aa9.16□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 CTXN1P60606 82 aa9.16□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 LCN6P62502 163 aa9.16□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 SERF2P84101 59 aa9.16□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 ALG10Q5BKT4 473 aa9.16□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.16□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 FAM216BQ8N7L0 139 aa9.16□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa9.16□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 OR4S2Q8NH73 311 aa9.16□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 TOMM40LQ969M1 308 aa9.16□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 PGAM5Q96HS1 289 aa9.16□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 TMEM56Q96MV1 263 aa9.16□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa9.16□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 MT-ATP6P00846 226 aa9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 DBHP09172 617 aa9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 TFPI2P48307 235 aa9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 FMODQ06828 376 aa9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 BATFQ16520 125 aa9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 ZNF74Q16587 644 aa9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 COX19Q49B96 90 aa9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 SLC22A6Q4U2R8 563 aa9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZWC4 215 aa9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 BATF2Q8N1L9 274 aa9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 OR5D14Q8NGL3 314 aa9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 SPSB1Q96BD6 273 aa9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 RAX2Q96IS3 184 aa9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 DUX3Q96PT4 197 aa9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 ATP5SQ99766 215 aa9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 MOB1AQ9H8S9 216 aa9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 ZNF586Q9NXT0 402 aa9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 SLC22A13Q9Y226 551 aa9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.15□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 SIRPB1O00241 398 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 H2BFMP0C1H6 154 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 SNU13P55769 128 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 MMDQ15546 238 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 MSMO1Q15800 293 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 PMCHL1Q16048 86 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 SMIM21Q3B7S5 101 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 PRR27Q6MZM9 219 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 FAM71F2Q6NXP2 309 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 DNM1P34Q6PK57 102 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 OSR2Q8N2R0 312 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 ASB10Q8WXI3 467 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 CCL13Q99616 98 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 SPATA25Q9BR10 227 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 TM2D1Q9BX74 207 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 MANBALQ9NQG1 85 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 B9D1Q9UPM9 204 aa9.14□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa9.13□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 HYPMO75409 117 aa9.13□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 SCGB1D2O95969 90 aa9.13□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 IFNA5P01569 189 aa9.13□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 NPBWR2P48146 333 aa9.13□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 DYNLT3P51808 116 aa9.13□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 PLAC9Q5JTB6 97 aa9.13□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa9.13□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa9.13□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 OR5D13Q8NGL4 314 aa9.13□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 TXN2Q99757 166 aa9.13□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 TMEM59Q9BXS4 323 aa9.13□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 GNG13Q9P2W3 67 aa9.13□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.13□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 PKD1P98161 4303 aa9.13□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 A0A0A6YYD4 124 aa9.12□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 A0A1B0GVY2 172 aa9.12□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 IGLC7A0M8Q6 106 aa9.12□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 IGSF23A1L1A6 192 aa9.12□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 GABRA2P47869 451 aa9.12□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 TMEM50BP56557 158 aa9.12□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 PRSS12P56730 875 aa9.12□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 PCBD1P61457 104 aa9.12□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 ARFRP1Q13795 201 aa9.12□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 ADIRFQ15847 76 aa9.12□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 SNAI3Q3KNW1 292 aa9.12□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 SPATA45Q537H7 98 aa9.12□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa9.12□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZN92 141 aa9.12□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 C19orf35Q6ZS72 473 aa9.12□□□□□ -0.95
HCG18-241ENST00000602290 NIT1Q86X76 327 aa9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms