RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601471.1

LINC00649-212, long intergenic non-protein coding RNA 649, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00649, Length 538 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00649-212ENST00000601471 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 TMED3Q9Y3Q3 217 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 C9orf170A2RU37 121 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 CENPXA8MT69 81 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 VAMP1P23763 118 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 NPBWR1P48145 328 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 DHRS2Q13268 280 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 C11orf87Q6NUJ2 197 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 OR4X1Q8NH49 305 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 ENY2Q9NPA8 101 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 FLVCR2Q9UPI3 526 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 LYSTQ99698 3801 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 LYRM1O43325 122 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 GNG7O60262 68 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 CLN5O75503 358 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 TMEM50AO95807 157 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 IGHV3-48P01763 117 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 OR4E1P0C645 316 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 NPY1RP25929 384 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 OPRK1P41145 380 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 BTNL8Q6UX41 500 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 DUSP18Q8NEJ0 188 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 DTD1Q8TEA8 209 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 S100ZQ8WXG8 99 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 C20orf85Q9H1P6 137 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 RBKSQ9H477 322 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 U3KQ87 197 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 CEBPZOSA8MTT3 80 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 TSPAN4O14817 238 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 NXPH3O95157 252 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 IGKV1-17P01599 117 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 SLC25A4P12235 298 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 PRSS54Q6PEW0 395 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 LYG2Q86SG7 212 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 NOXA1Q86UR1 476 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 MITD1Q8WV92 249 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 HIPK2Q9H2X6 1198 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 BATF3Q9NR55 127 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 TBC1D24Q9ULP9 559 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 TENM2Q9NT68 2774 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 CD7P09564 240 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 IGLC1P0CG04 106 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 CD81P60033 236 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 ASAH1Q13510 395 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 MLANAQ16655 118 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 GGNBP1Q5YKI7 109 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 OR1S1Q8NH92 325 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 NEURL2Q9BR09 285 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 SMPXQ9UHP9 88 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 RYR2Q92736 4967 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 MPTX1A8MV57 137 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 PRSS46E5RG02 174 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 CHEK1O14757 476 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 ADAP1O75689 374 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 TCRBP04435 133 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 HOXB5P09067 269 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 ID3Q02535 119 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 OR1S2Q8NGQ3 325 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 COQ8AQ8NI60 647 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 RNF2Q99496 336 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 GINS3Q9BRX5 216 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms