RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597180.1

IRF3-216, Transcript of interferon regulatory factor 3, human

TSL 5

Gene IRF3, Length 301 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRF3-216	ENST00000597180	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		13.75	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	MRAP	Q8TCY5	172 aa		13.75	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		13.75	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		13.75	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	ZNF320	A2RRD8	509 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	NDUFA4	O00483	81 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	SPN	P16150	400 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	NPBWR1	P48145	328 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	PRR25	Q96S07	402 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	PALMD	Q9NP74	551 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	GNG7	O60262	68 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	IFNA10	P01566	189 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	FOLR2	P14207	255 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	EDN2	P20800	178 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	DEFA1	P59665	94 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	DEFA3	P59666	94 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	ID3	Q02535	119 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	OR4X1	Q8NH49	305 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	SYNGR2	O43760	224 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	IL5	P05113	134 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	C8orf88	P0DMB2	117 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	GP9	P14770	177 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	CBLN1	P23435	193 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	MLANA	Q16655	118 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	TM4SF20	Q53R12	229 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	CLN5	O75503	358 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	LY86	O95711	162 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	TMEM50A	O95807	157 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	IAPP	P10997	89 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	SLC25A4	P12235	298 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	MARC2	Q969Z3	335 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	OR10C1	Q96KK4	312 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-216	ENST00000597180	C15orf62	A8K5M9	175 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180		K7EMT4	169 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	LCN12	Q6JVE5	192 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	CD69	Q07108	199 aa		13.69	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		13.69	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	WRB	O00258	174 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	SCGB2A1	O75556	95 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	IFNA4	P05014	189 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	RND2	P52198	227 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	RAB11A	P62491	216 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	MLX	Q9UH92	298 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		13.67	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	CCS	O14618	274 aa		13.67	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	PRAF2	O60831	178 aa		13.67	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	IGKV1-17	P01599	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		13.67	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		13.67	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		13.66	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		13.66	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	IGLC1	P0CG04	106 aa		13.66	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		13.66	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		13.66	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	SMIM8	Q96KF7	97 aa		13.66	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		13.66	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	ZNF785	A8K8V0	405 aa		13.65	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	PRSS46	E5RG02	174 aa		13.65	□□□□□ -0.22
IRF3-216	ENST00000597180	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22

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