RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-215	ENST00000589825	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		12.06	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	NOXA1	Q86UR1	476 aa		12.06	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	LGI3	Q8N145	548 aa		12.06	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		12.06	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	TMEM230	Q96A57	120 aa		12.06	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	SMPX	Q9UHP9	88 aa		12.06	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	AARD	Q4LEZ3	155 aa		12.05	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		12.05	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	CCDC190	Q86UF4	302 aa		12.05	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	TRIM63	Q969Q1	353 aa		12.05	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR10C1	Q96KK4	312 aa		12.05	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		12.05	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	TENM3	Q9P273	2699 aa		12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825		A0A0B4J2A0	478 aa		12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	NXPH3	O95157	252 aa		12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	TMEM50A	O95807	157 aa		12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	LYL1	P12980	280 aa		12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	CCR6	P51684	374 aa		12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	PRR13	Q9NZ81	148 aa		12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	CHEK1	O14757	476 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	CLN5	O75503	358 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	CD5	P06127	495 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	VAMP1	P23763	118 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	PAFAH1B2	P68402	229 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	SMCO1	Q147U7	214 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF79	Q15937	498 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	C2orf83	Q53S99	150 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	TRIQK	Q629K1	86 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR4X1	Q8NH49	305 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR1S1	Q8NH92	325 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	RNF2	Q99496	336 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		12.02	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		12.02	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		12.02	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	IFNA10	P01566	189 aa		12.02	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC25A4	P12235	298 aa		12.02	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	NPY1R	P25929	384 aa		12.02	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	BSX	Q3C1V8	233 aa		12.02	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		12.02	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	RETN	Q9HD89	108 aa		12.02	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		12.01	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825		A0A1W2PS18	150 aa		12.01	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	NPPC	P23582	126 aa		12.01	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	TFPI2	P48307	235 aa		12.01	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	APOC4	P55056	127 aa		12.01	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	TNFRSF9	Q07011	255 aa		12.01	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	MLANA	Q16655	118 aa		12.01	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		12.01	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825		U3KQ87	197 aa		12.01	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825		A0A1B0GU03	582 aa		12	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	NMS	Q5H8A3	153 aa		12	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	CASC10	Q5T4H9	136 aa		12	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	TCF24	Q7RTU0	167 aa		12	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		12	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	DTD1	Q8TEA8	209 aa		12	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	METTL26	Q96S19	204 aa		12	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	SRR	Q9GZT4	340 aa		12	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		12	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		12	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	CENPX	A8MT69	81 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	RND2	P52198	227 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825		Q8WTZ3	238 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	RBKS	Q9H477	322 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	IFNA4	P05014	189 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	TIGIT	Q495A1	244 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EFTUD2-215	ENST00000589825	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		11.98	□□□□□ -0.49

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