RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 CRYGCP07315 174 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A4P12235 298 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 P2RY1P47900 373 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 DEFB136Q30KP8 78 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 C2orf83Q53S99 150 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 C9orf62Q8N4C0 152 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 UBAC2Q8NBM4 344 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 OR5AU1Q8NGC0 362 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 ACY3Q96HD9 319 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 DUX3Q96PT4 197 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 MFFQ9GZY8 342 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 GNB4Q9HAV0 340 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXL17Q9UF56 701 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 HSPB11Q9Y547 144 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 SELENOKQ9Y6D0 94 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 HIVEP2P31629 2446 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TLN2Q9Y4G6 2542 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP5D1E7EU14 171 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 I3L2K1 104 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TSC22D2O75157 780 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFA7O95182 113 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 OPRK1P41145 380 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 HTR2BP41595 481 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 SULT1A1P50225 295 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 RND2P52198 227 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 RUNX1Q01196 453 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 FGL1Q08830 312 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC38A11Q08AI6 406 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2F1Q13607 317 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 C15orf32Q32M92 178 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TIGITQ495A1 244 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 AKIRIN2Q53H80 203 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 ACSM6Q6P461 480 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 CLEC19AQ6UXS0 136 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TMUB2Q71RG4 321 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC16A13Q7RTY0 426 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF114Q8NC26 417 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 OR5C1Q8NGR4 320 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 OR1P1Q8NH06 330 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 NPIPB3Q92617 1050 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF414Q96IQ9 312 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC140Q96MF4 163 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 AQP10Q96PS8 301 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 C19orf24Q9BVV8 132 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 C16orf95Q9H693 158 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 CLPSL1A2RUU4 121 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 INS-IGF2F8WCM5 200 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHG4P01861 327 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 PET100P0DJ07 73 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 EDN2P20800 178 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMB8P28062 276 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR183P32249 361 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB9AP51151 201 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 PROK1P58294 105 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TAS2R30P59541 319 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB11AP62491 216 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 AKR1C1Q04828 323 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP5G2Q06055 141 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 CD69Q07108 199 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 GAMTQ14353 236 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 Q56UQ5 140 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 PVRIGQ6DKI7 326 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM65Q6PI78 240 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 LILRB2Q8N423 598 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNRGQ8N5I3 272 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 OR10P1Q8NGE3 313 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 OR1S2Q8NGQ3 325 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 OR4F5Q8NH21 305 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 RSG1Q9BU20 258 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A31Q9H0C2 315 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 ARL6Q9H0F7 186 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 CYTL1Q9NRR1 136 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 U3KQ87 197 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A087WW49 117 aa4.65□□□□□ -1.67
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