RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 GCGP01275 180 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 GYPAP02724 150 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 HIST1H2BJP06899 126 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 FABP1P07148 127 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 HIST1H2BOP23527 126 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 HIST1H2BBP33778 126 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF137PP52743 207 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 HIST1H2BDP58876 126 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 B2MP61769 119 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 HIST1H2BCP62807 126 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 RPL8P62917 257 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 ADIPOQQ15848 244 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 LTC4SQ16873 150 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 RPL39P5Q59GN2 51 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 SPNS3Q6ZMD2 512 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 ABHD12Q8N2K0 398 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF383Q8NA42 475 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 TEX45Q8NA69 505 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 DEFB108BQ8NET1 73 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 OR1L6Q8NGR2 347 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 OR1L4Q8NGR5 311 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 OR10X1Q8NGY0 326 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 C11orf52Q96A22 123 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 C5orf30Q96GV9 206 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 CCL13Q99616 98 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 HIST1H2BNQ99877 126 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 HIST1H2BMQ99879 126 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 DCTN5Q9BTE1 182 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 GGTLC1Q9BX51 225 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 SLC25A22Q9H936 323 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 DYNLRB1Q9NP97 96 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 NIT2Q9NQR4 276 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM106BQ9NUM4 274 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 FUT9Q9Y231 359 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 WASHC3Q9Y3C0 194 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 RFNGQ9Y644 331 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 DYSFO75923 2080 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 TANC2Q9HCD6 1990 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 DSCAML1Q8TD84 2053 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF318Q5VUA4 2279 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 A0A0C4DFX4 3053 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 HELTA6NFD8 242 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 DPRXA6NFQ7 191 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 PCP4L1A6NKN8 68 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 IFITM10A6NMD0 228 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 K7ENP7 123 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 DVL1O14640 695 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 NDUFB4O95168 129 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 CA2P00918 260 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 IGKV1D-33P01593 117 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 IGKV1-33P01594 117 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 MT-ND6P03923 174 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 TRGC2P03986 189 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 CXCL1P09341 107 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 OR10J4P0C629 311 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 TRGC1P0CF51 173 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 C8orf88P0DMB2 117 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 CT45A6P0DMU7 189 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 CT45A5P0DMU8 189 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 CT45A7P0DMV0 189 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 SFTPCP11686 197 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 GCHFRP30047 84 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 S100A7P31151 101 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 TDGF1P3P51864 188 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 TAS2R60P59551 318 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 BPIFB3P59826 476 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 CCL8P80075 99 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 BSPH1Q075Z2 132 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 TFF3Q07654 80 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 TIGITQ495A1 244 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 NCMAPQ5T1S8 102 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 WDR73Q6P4I2 378 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 C16orf82Q7Z2V1 217 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 LINC01551Q86U37 167 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM183AQ8IXX5 376 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 MMD2Q8IY49 270 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 OR4P4Q8NGL7 312 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 OR10G8Q8NGN5 311 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM170AQ8WVE7 144 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM18Q96B42 140 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 SMIM12Q96EX1 92 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-215ENST00000583289 MGST2Q99735 147 aa3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms