RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576346.5

NSF-208, Transcript of N-ethylmaleimide sensitive factor, vesicle fusing ATPase, human

TSL 4

Gene NSF, Length 710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSF-208	ENST00000576346	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	MGST2	Q99735	147 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	CALY	Q9NYX4	217 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	RFNG	Q9Y644	331 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	USF3	Q68DE3	2245 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	APC	P25054	2843 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346		A0A087WWL8	130 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346		A0A0U1RQK1	487 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346		A0A1W2PRE2	83 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	hADV38S2	A0JD32	116 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	ZNF320	A2RRD8	509 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	LINC00473	A8K010	186 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346		M0R143	59 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	ISLR	O14498	428 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	NDUFB4	O95168	129 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	OR5G3	P0C626	314 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	OR9G9	P0C7N8	305 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	CRISP2	P16562	243 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	GLRX	P35754	106 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	ATP5G3	P48201	142 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	GNG4	P50150	75 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	ERVFC1-1	P60608	527 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	GNB1	P62873	340 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346		Q0VG73	95 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	EFNB3	Q15768	340 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346		Q8N7P7	452 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	NUP37	Q8NFH4	326 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	SVIP	Q8NHG7	77 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	DDB2	Q92466	427 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	C5orf30	Q96GV9	206 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	ZNF714	Q96N38	554 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	MS4A10	Q96PG2	267 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	OR2V2	Q96R30	315 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	OSTC	Q9NRP0	149 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	BET1L	Q9NYM9	111 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	RNF7	Q9UBF6	113 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	NAGK	Q9UJ70	344 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	C20orf202	A1L168	122 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	CORT	O00230	105 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	WNT9B	O14905	357 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	TNFSF13	O75888	250 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	SCGB1D1	O95968	90 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	REG1A	P05451	166 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	CD55	P08174	381 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	OR4A8	P0C604	315 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NSF-208	ENST00000576346	C8orf88	P0DMB2	117 aa		3.07	□□□□□ -1.92

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