RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568294.5

HDGFL3-206, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

TSL 4

Gene HDGFL3, Length 3,397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-206ENST00000568294 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.31□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 LYNX1G3V0Z9 82 aa7.31□□□□□ -1.24
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HDGFL3-206ENST00000568294 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.31□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 LYNX1P0DP58 116 aa7.31□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 PDLIM4P50479 330 aa7.31□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 SLAQ13239 276 aa7.31□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 MUC21Q5SSG8 566 aa7.31□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.31□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.31□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 OR52E5Q8NH55 327 aa7.31□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.31□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 ATRXP46100 2492 aa7.3□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.3□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 IGHV1-46P01743 117 aa7.3□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 APCSP02743 223 aa7.3□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 COX7A1P24310 79 aa7.3□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 BRS3P32247 399 aa7.3□□□□□ -1.24
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HDGFL3-206ENST00000568294 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.3□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 ZNF503Q96F45 646 aa7.3□□□□□ -1.24
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HDGFL3-206ENST00000568294 DKK4Q9UBT3 224 aa7.3□□□□□ -1.24
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HDGFL3-206ENST00000568294 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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HDGFL3-206ENST00000568294 APOA2P02652 100 aa7.3□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 ZNF138P52744 262 aa7.3□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 UBE2G1P62253 170 aa7.3□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.3□□□□□ -1.24
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HDGFL3-206ENST00000568294 PRSS46E5RG02 174 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 RAB1CQ92928 201 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 PAXXQ9BUH6 204 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 M0R2Z0 102 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 TAS2R45P59539 299 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 ERHP84090 104 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 MZT1Q08AG7 82 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 TNXAQ16473 311 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 ZADH2Q8N4Q0 377 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 RITA1Q96K30 269 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 GAFA1Q96PS6 74 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 PRNDQ9UKY0 176 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 LRBAP50851 2863 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 J3QW42 95 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 BMPR1BO00238 502 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 UPK2O00526 184 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 C8orf88P0DMB2 117 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 TNFSF4P23510 183 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 PLGLAQ15195 96 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 NEUROG1Q92886 237 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 TMEM14BQ9NUH8 114 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 A0A1W2PS18 150 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 PGPA6NDG6 321 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 SNAI2O43623 268 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 C3orf79P0CE67 100 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 CD99P14209 185 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 CNTFRP26992 372 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 LYZP61626 148 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 HIGD1CA8MV81 97 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 KLK10O43240 276 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 GPX1P07203 203 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 PRR20EP86478 221 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 PRR20CP86479 221 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 PRR20DP86480 221 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 PRR20BP86481 221 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 PRR20AP86496 221 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 PRCDQ00LT1 54 aa7.28□□□□□ -1.24
HDGFL3-206ENST00000568294 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.28□□□□□ -1.24
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