RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563645.1

GDE1-202, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GDE1, Length 769 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-202ENST00000563645 A0A1W2PPM0 123 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 TMEM262E9PQX1 116 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 SLC17A2O00624 439 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 OVOL1O14753 267 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 CHEK1O14757 476 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 SOCS1O15524 211 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 HCRTO43612 131 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 STK17BO94768 372 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 SOD1P00441 154 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 CA2P00918 260 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 SRP19P09132 144 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 LINC00032P0C843 101 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 MDKP21741 143 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 CA7P43166 264 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 DLX1P56177 255 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 PMAIP1Q13794 54 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 OR7A5Q15622 319 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 PMCHL1Q16048 86 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 CLEC12BQ2HXU8 276 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 LINC00303Q3SY05 128 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 TTC32Q5I0X7 151 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 LEG1Q6P5S2 330 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 SPATA12Q7Z6I5 190 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 OR10P1Q8NGE3 313 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 TYMSOSQ8TAI1 123 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 SSC4DQ8WTU2 575 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 TMEM37Q8WXS4 190 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 BORCS7Q96B45 105 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 ELSPBP1Q96BH3 223 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 BMFQ96LC9 184 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 GABARAPL3Q9BY60 117 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 CHST6Q9GZX3 395 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 RERGLQ9H628 205 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 BCL2L10Q9HD36 194 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 Q9UF83 564 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 SCML2Q9UQR0 700 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 KLF12Q9Y4X4 402 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 MPC1Q9Y5U8 109 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 TNS2Q63HR2 1409 aa2.85□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 MRC1P22897 1456 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 GLI3P10071 1580 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 MYBPHLA2RUH7 354 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 C5orf63A6NC05 138 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 ARRDC5A6NEK1 342 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 H3BTX0 84 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 H3BUT2 72 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 ZNF253O75346 499 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 ZNF737O75373 536 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 LSM8O95777 96 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 NUDT14O95848 222 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 HBE1P02100 147 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 VDAC1P21796 283 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 GPX3P22352 226 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 KRTAP5-9P26371 169 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 DUTP33316 252 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 PFN2P35080 140 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 RPL22P35268 128 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 CCR2P41597 374 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 GALR1P47211 349 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 EMDP50402 254 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 CAV3P56539 151 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 ZNF85Q03923 595 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 UNC119Q13432 240 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 WFDC2Q14508 124 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 IHHQ14623 411 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 SPHARQ15513 63 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 MSMO1Q15800 293 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 CEACAM16Q2WEN9 425 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 SPRNQ5BIV9 151 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 VAX1Q5SQQ9 334 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 FAM27D1Q5T7N8 215 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 ANKRD37Q7Z713 158 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 CMC1Q7Z7K0 106 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 PIANPQ8IYJ0 282 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 SLC25A45Q8N413 288 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 OR4K17Q8NGC6 315 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 SMIM4Q8WVI0 70 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 UBE2E3Q969T4 207 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 C11orf52Q96A22 123 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 DPH3Q96FX2 82 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 PRELID3AQ96N28 172 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 ZNF670Q9BS34 389 aa2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms