RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553334.1

RAD51B-215, Transcript of RAD51 paralog B, human

TSL 3

Gene RAD51B, Length 249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD51B-215	ENST00000553334	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	VSIR	Q9H7M9	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334		A0A1B0GU03	582 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	CTDSPL	O15194	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	CD3D	P04234	171 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	PGAM2	P15259	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	SNCA	P37840	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	NPBWR1	P48145	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	PIGP	P57054	158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	IFITM3	Q01628	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	ZNF79	Q15937	498 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	OR11H2	Q8NH07	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	TP53RK	Q96S44	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	RARRES2	Q99969	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	FAM25A	B3EWG3	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	FAM25C	B3EWG5	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	FAM25G	B3EWG6	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	IFNA17	P01571	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	CD5	P06127	495 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	DEFB131A	P59861	70 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	OXA1L	Q15070	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	RGS21	Q2M5E4	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	SP6	Q3SY56	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334		Q6ZRM9	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	TERB2	Q8NHR7	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	ABHD1	Q96SE0	405 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334		A0A0G2JRQ6	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334		A0A1W2PS18	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	DEFB4A	O15263	64 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	CLN5	O75503	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	ATG12	O94817	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	PTTG1	O95997	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	CD74	P04233	296 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	IFNA4	P05014	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	IL7	P13232	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	NPPC	P23582	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	UCP1	P25874	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	DEFA1	P59665	94 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	DEFA3	P59666	94 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	IL18	Q14116	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	TMEM187	Q14656	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	BAK1	Q16611	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334		Q6ZNX1	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD51B-215	ENST00000553334	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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