RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ATP6V0BQ99437 205 aa6.61□□□□□ -1.35
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PTPRB-209ENST00000550857 STAG3L2P0CL84 134 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 CCKARP32238 428 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 MFAP2P55001 183 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 MIC13Q5XKP0 118 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 RNF152Q8N8N0 203 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.59□□□□□ -1.36
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