RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 CLN5O75503 358 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 IFNA17P01571 189 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 IGKV1-17P01599 117 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 OR5AC1P0C628 307 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 SNCAP37840 140 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 NPBWR1P48145 328 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF600Q6ZNG1 722 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 OR4X1Q8NH49 305 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 OR52E5Q8NH55 327 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 GPR146Q96CH1 333 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 SOSTQ9BQB4 213 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 COPZ2Q9P299 210 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 U3KQE9 123 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 AGRNO00468 2067 aa8.65□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 MPTX1A8MV57 137 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 CTDSPLO15194 276 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 B3GALNT1O75752 331 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 CRYBB3P26998 211 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 AKR1C2P52895 323 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 PMS2P11Q13670 270 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 TRIM16LQ309B1 348 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC35G3Q8N808 338 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 C15orf40Q8WUR7 153 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 CXorf65A6NEN9 183 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 ATG12O94817 140 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 NXPH3O95157 252 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 CD5P06127 495 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 SPCS3P61009 180 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 OR4C16Q8NGL9 310 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 SMIM4Q8WVI0 70 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM230Q96A57 120 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 GINS3Q9BRX5 216 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 NAA60Q9H7X0 242 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 NUPR2A6NF83 97 aa8.62□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa8.62□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 K7EQG2 157 aa8.62□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 CORTO00230 105 aa8.62□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 IGLC1P0CG04 106 aa8.62□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 DEFB131AP59861 70 aa8.62□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 PAFAH1B2P68402 229 aa8.62□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 MEF2DQ14814 521 aa8.62□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 TIGITQ495A1 244 aa8.62□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 C2orf83Q53S99 150 aa8.62□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 LEMD1Q68G75 181 aa8.62□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 PRSS54Q6PEW0 395 aa8.62□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 GPR141Q7Z602 305 aa8.62□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM219AQ8IW50 185 aa8.62□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 DCANP1Q8TF63 244 aa8.62□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.62□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 RARRES2Q99969 163 aa8.62□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa8.61□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 RGS5O15539 181 aa8.61□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 LY6G6CO95867 125 aa8.61□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 AKAIN1P0CW23 69 aa8.61□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 NPPCP23582 126 aa8.61□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 OPRK1P41145 380 aa8.61□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 DHODHQ02127 395 aa8.61□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM187Q14656 261 aa8.61□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 NMSQ5H8A3 153 aa8.61□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 OR51S1Q8NGJ8 323 aa8.61□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 DIRAS2Q96HU8 199 aa8.61□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 PDCD10Q9BUL8 212 aa8.61□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 PRR13Q9NZ81 148 aa8.61□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 CACNG5Q9UF02 275 aa8.61□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 DISC1C4P0D8 188 aa8.6□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 HTR2BP41595 481 aa8.6□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM268Q5VZI3 342 aa8.6□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 OR11H2Q8NH07 326 aa8.6□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.59□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.59□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1W2PS18 150 aa8.59□□□□□ -1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms