RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 MCUBQ9NWR8 336 aa6.71□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.71□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 GPR132Q9UNW8 380 aa6.71□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.71□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 SCGB2A1O75556 95 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 TMEM50AO95807 157 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 P0C879 139 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 NPPCP23582 126 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 TNFSF8P32971 234 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 BMI1P35226 326 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 SPCS3P61009 180 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 MLANAQ16655 118 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 Q6ZRM9 215 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 FAM219AQ8IW50 185 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 MCFD2Q8NI22 146 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 AGRNO00468 2067 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 A0A0G2JRQ6 117 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 CCDC160A6NGH7 325 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 UBE2CO00762 179 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 SPRY2O43597 315 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 NXPH3O95157 252 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 CD5P06127 495 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 AKR1C4P17516 323 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 HTR2BP41595 481 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 DEFB135Q30KP9 77 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 Q6ZWC4 215 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 TCF24Q7RTU0 167 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 OR52E5Q8NH55 327 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 GPR146Q96CH1 333 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 GALNT14Q96FL9 552 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 CACNG5Q9UF02 275 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 A0A1W2PS18 150 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 H3BMQ9 156 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 CLN5O75503 358 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 DFFBO76075 338 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 ZNF124Q15973 351 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 PYDC2Q56P42 97 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 OR4X1Q8NH49 305 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 ST8SIA2Q92186 375 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 METTL26Q96S19 204 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 A0A0J9YWU9 116 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 A0A1B0GU03 582 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 ANXA3P12429 323 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 S100A5P33763 92 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 TIGITQ495A1 244 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 NOXA1Q86UR1 476 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 LILRB2Q8N423 598 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 Q8WTZ3 238 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 CSTL1Q9H114 145 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 PRR13Q9NZ81 148 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-222ENST00000540445 RABAC1Q9UI14 185 aa6.67□□□□□ -1.34
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